RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290921.10

CTBP1-201, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTBP1, Length 2,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-201ENST00000290921 ST3GAL1Q11201 340 aa30.15■■■□□ 2.42
CTBP1-201ENST00000290921 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
CTBP1-201ENST00000290921 NECTIN1Q15223 517 aa30.14■■■□□ 2.42
CTBP1-201ENST00000290921 ME3Q16798 604 aa30.14■■■□□ 2.42
CTBP1-201ENST00000290921 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 EVI5LQ96CN4 794 aa30.13■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC171Q6TFL3 1326 aa30.12■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 NECAB1Q8N987 351 aa30.12■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 ARHGEF25Q86VW2 580 aa30.12■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 SPTLC3Q9NUV7 552 aa30.12■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa30.11■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 AP5Z1O43299 807 aa30.11■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 AACSQ86V21 672 aa30.11■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 GCP02774 474 aa30.11■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 CREB3L3Q68CJ9 461 aa30.1■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 LINS1Q8NG48 757 aa30.1■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.09■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 SUCLG2Q96I99 432 aa30.09■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 ARID3AQ99856 593 aa30.09■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 TPCN1Q9ULQ1 816 aa30.09■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 GRM8O00222 908 aa30.08■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 KCNJ4P48050 445 aa30.08■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 ANKRD24Q8TF21 1146 aa30.08■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 SLIT3O75094 1523 aa30.08■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 UTYO14607 1347 aa30.08■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC192P0DO97 292 aa30.08■■■□□ 2.41
CTBP1-201ENST00000290921 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
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CTBP1-201ENST00000290921 KAZALD1Q96I82 304 aa30.07■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 FAM227BQ96M60 508 aa30.07■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 MAP4K1Q92918 833 aa30.06■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 SASH1O94885 1247 aa30.06■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP30.06■■■□□ 2.46e-7■■■■■ 32.3
CTBP1-201ENST00000290921 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 TTC6Q86TZ1 520 aa30.06■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 KRT85P78386 507 aa30.05■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa30.05■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 DDX58O95786 925 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 HIP1O00291 1037 aa30.04■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 TSC1Q92574 1164 aa30.04■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 KCNF1Q9H3M0 494 aa30.04■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP30.04■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 SLC27A2O14975 620 aa30.03■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 TPM3P06753 285 aa30.03■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 PSMA5P28066 241 aa30.03■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP30.03■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 CDC37L1Q7L3B6 337 aa30.03■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 FERMT3Q86UX7 667 aa30.03■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 KIAA1524Q8TCG1 905 aa30.03■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 SPC24Q8NBT2 197 aa30.02■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 CHMP3Q9Y3E7 222 aa30.02■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.02■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
CTBP1-201ENST00000290921 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 PDIA6Q15084 440 aa30.01■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 ORAI2Q96SN7 254 aa30.01■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 SNRKQ9NRH2 765 aa30.01■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 PYCARDQ9ULZ3 195 aa30.01■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 ELP1O95163 1332 aa30.01■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 MAP3K11Q16584 847 aa30.01■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 FAM173BQ6P4H8 233 aa30.01■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 NUP62CLQ9H1M0 184 aa30.01■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa30■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 LIG1P18858 919 aa30■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 PDCP20941 246 aa30■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa30■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF710Q8N1W2 664 aa29.99■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 FAM200AQ8TCP9 573 aa29.99■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 CAMK4Q16566 473 aa29.99■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa29.99■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.99■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 IGKV5-2P06315 115 aa29.98■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 KIF3AQ9Y496 699 aa29.98■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 A0A0D9SFI3 127 aa29.98■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 ANKRD1Q15327 319 aa29.98■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 TCEANC2Q96MN5 208 aa29.98■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 MRVI1Q9Y6F6 885 aa29.98■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 TYRO3Q06418 890 aa29.97■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 RNF20Q5VTR2 975 aa29.97■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.97■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 FSD1Q9BTV5 496 aa29.97■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 SIL1Q9H173 461 aa29.96■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 BOLA2Q9H3K6 86 aa29.96■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 RPS6KB1P23443 525 aa29.96■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 RIC3Q7Z5B4 369 aa29.96■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
CTBP1-201ENST00000290921 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
CTBP1-201ENST00000290921 MED23Q9ULK4 1368 aa29.94■■■□□ 2.38
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