RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289228.6

ACTR1B-201, Transcript of ARP1 actin related protein 1 homolog B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTR1B, Length 2,243 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1B-201ENST00000289228 MAP4K1Q92918 833 aa27.06■■□□□ 1.92
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ACTR1B-201ENST00000289228 RIC3Q7Z5B4 369 aa27.06■■□□□ 1.92
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ACTR1B-201ENST00000289228 ME3Q16798 604 aa27.05■■□□□ 1.92
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ACTR1B-201ENST00000289228 ZNF790Q6PG37 636 aa27.02■■□□□ 1.92
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ACTR1B-201ENST00000289228 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
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ACTR1B-201ENST00000289228 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
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ACTR1B-201ENST00000289228 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.94■■□□□ 1.9
ACTR1B-201ENST00000289228 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
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ACTR1B-201ENST00000289228 UQCRHLA0A096LP55 91 aa26.89■■□□□ 1.89
ACTR1B-201ENST00000289228 UQCRHP07919 91 aa26.89■■□□□ 1.89
ACTR1B-201ENST00000289228 TNNI3KQ59H18 835 aa26.89■■□□□ 1.89
ACTR1B-201ENST00000289228 TTC6Q86TZ1 520 aa26.89■■□□□ 1.89
ACTR1B-201ENST00000289228 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa26.89■■□□□ 1.89
ACTR1B-201ENST00000289228 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.88■■□□□ 1.89
ACTR1B-201ENST00000289228 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
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