RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225298.11

UTP18-201, Transcript of UTP18, small subunit processome component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UTP18, Length 1,894 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18-201ENST00000225298 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
UTP18-201ENST00000225298 RILPL2Q969X0 211 aa23.11■■□□□ 1.29
UTP18-201ENST00000225298 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.11■■□□□ 1.29
UTP18-201ENST00000225298 REC8O95072 547 aa23.11■■□□□ 1.29
UTP18-201ENST00000225298 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
UTP18-201ENST00000225298 SIL1Q9H173 461 aa23.11■■□□□ 1.29
UTP18-201ENST00000225298 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
UTP18-201ENST00000225298 TJP1Q07157 1748 aa23.1■■□□□ 1.29
UTP18-201ENST00000225298 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
UTP18-201ENST00000225298 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
UTP18-201ENST00000225298 FOXO4P98177 505 aa23.09■■□□□ 1.29
UTP18-201ENST00000225298 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.09■■□□□ 1.29
UTP18-201ENST00000225298 AACSQ86V21 672 aa23.09■■□□□ 1.29
UTP18-201ENST00000225298 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
UTP18-201ENST00000225298 AFF2P51816 1311 aa23.09■■□□□ 1.29
UTP18-201ENST00000225298 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
UTP18-201ENST00000225298 CNTROBQ8N137 903 aa23.09■■□□□ 1.29
UTP18-201ENST00000225298 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
UTP18-201ENST00000225298 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.09■■□□□ 1.29
UTP18-201ENST00000225298 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
UTP18-201ENST00000225298 KCNQ2O43526 872 aa23.07■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 SASH1O94885 1247 aa23.07■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.06■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.05■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 HLFQ16534 295 aa23.05■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 NLRP10Q86W26 655 aa23.05■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.05■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.05■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.04■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa23.04■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.04■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 ITPK1Q13572 414 aa23.03■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 GPTP24298 496 aa23.02■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 CHMLP26374 656 aa23.02■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 FAM89AQ96GI7 184 aa23.02■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
UTP18-201ENST00000225298 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 SLC4A3P48751 1232 aa23.01■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 FBXO3Q9UK99 471 aa23.01■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.01■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 ATRNO75882 1429 aa23.01■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.01■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 USP26Q9BXU7 913 aa23■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 CIAO1O76071 339 aa23■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 MCCP23508 829 aa23■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 TFCP2Q12800 502 aa23■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 TAF7LQ5H9L4 462 aa23■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 HSCBQ8IWL3 235 aa23■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 PARP10Q53GL7 1025 aa22.99■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 TNNI3KQ59H18 835 aa22.99■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.99■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.99■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.99■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 EYA2O00167 538 aa22.98■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 EVI5LQ96CN4 794 aa22.98■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 AK7Q96M32 723 aa22.98■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 GPR108Q9NPR9 543 aa22.98■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.98■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.98■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.98■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 RREB1Q92766 1687 aa22.97■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 HIP1O00291 1037 aa22.97■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 CSF1RP07333 972 aa22.97■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.97■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 NUP98P52948 1817 aa22.97■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.96■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 PDE8AO60658 829 aa22.96■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.96■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.95■■□□□ 1.27
UTP18-201ENST00000225298 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
UTP18-201ENST00000225298 SNX21Q969T3 373 aa22.95■■□□□ 1.26
UTP18-201ENST00000225298 AK9Q5TCS8 1911 aa22.95■■□□□ 1.26
UTP18-201ENST00000225298 NHSQ6T4R5 1651 aa22.95■■□□□ 1.26
UTP18-201ENST00000225298 CAMTA2O94983 1202 aa22.94■■□□□ 1.26
UTP18-201ENST00000225298 CTSWP56202 376 aa22.94■■□□□ 1.26
UTP18-201ENST00000225298 RABEP1Q15276 862 aa22.94■■□□□ 1.26
UTP18-201ENST00000225298 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.94■■□□□ 1.26
UTP18-201ENST00000225298 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
UTP18-201ENST00000225298 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.94■■□□□ 1.26
UTP18-201ENST00000225298 RGL2O15211 777 aa22.94■■□□□ 1.26
UTP18-201ENST00000225298 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.94■■□□□ 1.26
UTP18-201ENST00000225298 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.94■■□□□ 1.26
UTP18-201ENST00000225298 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.93■■□□□ 1.26
UTP18-201ENST00000225298 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.93■■□□□ 1.26
UTP18-201ENST00000225298 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms