RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631121.1

SPTAN1-225, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 438 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-225ENST00000631121 GAL3ST4Q96RP7 486 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 LPAR4Q99677 370 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 PITX2Q99697 317 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 PRRX2Q99811 253 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 ZPBPQ9BS86 351 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 ITPAQ9BY32 194 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 VN1R1Q9GZP7 353 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 TMEM9BQ9NQ34 198 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 FBXO8Q9NRD0 319 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 UBQLN4Q9NRR5 601 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 SLC39A1Q9NY26 324 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 A4GNTQ9UNA3 340 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 TMEM5Q9Y2B1 443 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 CDH23Q9H251 3354 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 LAMA3Q16787 3333 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 EML5Q05BV3 1969 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 CDHR4A6H8M9 788 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 IDSB3KWA1 339 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 B4E171 279 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 MEN1O00255 615 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 FFAR1O14842 300 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 FAM20BO75063 409 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 ALOX12BO75342 701 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 ZNF806P0C7X5 589 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 CDK4P11802 303 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 CBLP22681 906 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 ELK4P28324 431 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 CCKBRP32239 447 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 TSPAN7P41732 249 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 STAT5AP42229 794 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 GCGRP47871 477 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 GPR143P51810 404 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 SMSP52788 366 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 SLC37A1P57057 533 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 MC2RQ01718 297 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 TEKQ02763 1124 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 CD47Q08722 323 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 PLCXD2Q0VAA5 305 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 CDK5R2Q13319 367 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 RAPSNQ13702 412 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 OR1Q1Q15612 314 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 MEP1AQ16819 746 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 PDZK1Q5T2W1 519 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 DCAF12Q5T6F0 453 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 ZNF773Q6PK81 442 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 HSDL2Q6YN16 418 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 PTCHD4Q6ZW05 846 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 OLIG3Q7RTU3 272 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 GPR141Q7Z602 305 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 HMGN2P46Q86SG4 172 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 LACC1Q8IV20 430 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 CLIP4Q8N3C7 705 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 BCORP1Q8N888 145 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 ZNF615Q8N8J6 731 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 C17orf47Q8NEP4 570 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 OR1N1Q8NGS0 311 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 SLC7A13Q8TCU3 470 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 OSTF1Q92882 214 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 TSLPQ969D9 159 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 MYDGFQ969H8 173 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 ZG16BQ96DA0 208 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 PLEKHA8Q96JA3 519 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 MPP4Q96JB8 637 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 NODALQ96S42 347 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 CRB3Q9BUF7 120 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 ULBP3Q9BZM4 244 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 CCDC90BQ9GZT6 254 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 CTPS2Q9NRF8 586 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 RXFP3Q9NSD7 469 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 RLIMQ9NVW2 624 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 SLC7A7Q9UM01 511 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 MED31Q9Y3C7 131 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-225ENST00000631121 R4GN57 208 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms