RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0G2JN53 185 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO1GB0I1T2 1018 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 H3BNX3 289 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 GPIP06744 558 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 CLCN2P51788 898 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 MANFP55145 182 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 DLX5P56178 289 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 IFNEQ86WN2 208 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM52Q8NDY8 209 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFP28Q8NHY6 868 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF559Q9BR84 538 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ARMC1Q9NVT9 282 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 UTS2RQ9UKP6 389 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 SPACA6W5XKT8 324 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCA4P78363 2273 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 H0Y3Z8 333 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 AIFM1O95831 613 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ALDH9A1P49189 494 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 FADDQ13158 208 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 RUNX2Q13950 521 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 VEZF1Q14119 521 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 RTL6Q6ICC9 239 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 MMP21Q8N119 569 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM156Q8N614 296 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PSD4Q8NDX1 1056 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 HIPK4Q8NE63 616 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PYDC1Q8WXC3 89 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PNPLA3Q9NST1 481 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 EGFL7Q9UHF1 273 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXW2Q9UKT8 454 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 MMACHCQ9Y4U1 282 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM215AQ9Y5M1 114 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 LIPGQ9Y5X9 500 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 EML6Q6ZMW3 1958 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 GLSO94925 669 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 NR2F6P10588 404 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 LIM2P55344 173 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFRSF17Q02223 184 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 RBBP4Q09028 425 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 RGNQ15493 299 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 GXYLT1Q4G148 440 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM200AQ86VY9 491 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 NCLNQ969V3 563 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 NSMCE2Q96MF7 247 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 GIMAP4Q9NUV9 329 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 AP4S1Q9Y587 144 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM221AA4D161 298 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 PGRMC2O15173 223 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 IFI6P09912 130 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 BMP2P12643 396 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 CD99P14209 185 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP6V1B2P21281 511 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 NTSP30990 170 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 MPIP34949 423 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 MVDP53602 400 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 PPIAP62937 165 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM64Q6YI46 380 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2M7Q8NG81 312 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 VMP1Q96GC9 406 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF681Q96N22 645 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 AMDHD1Q96NU7 426 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXC2Q99958 501 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TCRBV5S2A0A599 114 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM166BA8MTA8 275 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 NPIPA2E9PIF3 369 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 NPIPA3F8WFD2 350 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6B1O95007 311 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHG3P01860 377 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 CPN2P22792 545 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 SSR4P51571 173 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 GAB1Q13480 694 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 VMACQ2NL98 169 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 OR52E8Q6IFG1 317 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP2R1Q6VVX0 501 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 LIX1LQ8IVB5 337 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TANKQ92844 425 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 MOAP1Q96BY2 351 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 NEURL3Q96EH8 262 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35A5Q9BS91 424 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TTTY12Q9BZ98 90 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 GSTA4O15217 222 aa22.11■■□□□ 1.13
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