RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 SDCCAG3Q96C92 435 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 G6PC3Q9BUM1 346 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 RTN4RQ9BZR6 473 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 GPR45Q9Y5Y3 372 aa22.63■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 AHRRA9YTQ3 701 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 E9PBE3 544 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 HTR1EP28566 365 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 GCKP35557 465 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 DCTP40126 519 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 GRAMD1BQ3KR37 738 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 SPANXN4Q5MJ08 99 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 APOOLQ6UXV4 268 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 OR14L1PQ8NHC6 308 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 LRRC8CQ8TDW0 803 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 CDS1Q92903 461 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 TEX37Q96LM6 180 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 CHST11Q9NPF2 352 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 ALKBH4Q9NXW9 302 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 TAS2R10Q9NYW0 307 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 PCDHGB4Q9UN71 923 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 RNF6Q9Y252 685 aa22.62■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 C17orf51A8MQB3 221 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 ALG1L2C9J202 215 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 GLI4P10075 376 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 CHRNB4P30926 498 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 UFM1P61960 85 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 FIGNL1Q6PIW4 674 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 IFNEQ86WN2 208 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 OR2M3Q8NG83 312 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 OR4K17Q8NGC6 315 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 OR4C3Q8NH37 302 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 OR5AK3PQ8NH89 298 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 ADAMTS15Q8TE58 950 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 HHATLQ9HCP6 504 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 DKKL1Q9UK85 242 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 IDO1P14902 403 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 TBXA2RP21731 343 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 DPP4P27487 766 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 S100A3P33764 101 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 SOAT1P35610 550 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 GFRA1P56159 465 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 PPP2R2AP63151 447 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 C17orf67Q0P5P2 114 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 GANABQ14697 944 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 DCST1Q5T197 706 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 NXNQ6DKJ4 435 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 ZAR1Q86SH2 424 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 GALNT10Q86SR1 603 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 MARCH3Q86UD3 253 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 OR4A15Q8NGL6 344 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 DUSP19Q8WTR2 217 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 WDYHV1Q96HA8 205 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 DSN1Q9H410 356 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 FBXO34Q9NWN3 711 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 USH1CQ9Y6N9 552 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 ZIC3O60481 467 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 ANGPTL1O95841 491 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 GRNP28799 593 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 ANKRD46Q86W74 232 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 LILRB4Q8NHJ6 448 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 CHMP6Q96FZ7 201 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 UBQLN4Q9NRR5 601 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 BTNL2Q9UIR0 455 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 MED12LQ86YW9 2145 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 CPN1P15169 458 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 CHMP24386 653 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 IL12AP29459 219 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 NME5P56597 212 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 STX5Q13190 355 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 CCNJQ5T5M9 372 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 ZNF787Q6DD87 383 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 AAGABQ6PD74 315 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 EPGNQ6UW88 154 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 ENPP6Q6UWR7 440 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 C6orf120Q7Z4R8 191 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 DYDC1Q8WWB3 177 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 CCDC115Q96NT0 180 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 OR52B2Q96RD2 323 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 PTGES2Q9H7Z7 377 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 MED11Q9P086 117 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-220ENST00000618056 DCHS2Q6V1P9 2916 aa22.59■■□□□ 1.21
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