RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612121.4

LTBP4-233, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 3

Gene LTBP4, Length 755 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-233	ENST00000612121	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	OR7G2	Q8NG99	324 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	MTBP	Q96DY7	904 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	STOML1	Q9UBI4	398 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	DLX3	O60479	287 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	NTN1	O95631	604 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	OPN1LW	P04000	364 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	SLC25A16	P16260	332 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	ZNF17	P17021	662 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	IGFBP5	P24593	272 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	C21orf58	P58505	322 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	ACAP2	Q15057	778 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	SLC35F6	Q8N357	371 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	NPAS1	Q99742	590 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121		A0A0J9YW62	118 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	TNFSF11	O14788	317 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	GMFG	O60234	142 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	PDYN	P01213	254 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	C2	P06681	752 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	AGAP6	Q5VW22	663 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	APOOL	Q6UXV4	268 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	ZNF525	Q8N782	197 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	PPM1N	Q8N819	430 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	GPR78	Q96P69	363 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	VDAC3	Q9Y277	283 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	SNX24	Q9Y343	169 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	ESRRB	O95718	433 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	IL33	O95760	270 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	ANGPTL1	O95841	491 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	ADA	P00813	363 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	CDH11	P55287	796 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	RAC1	P63000	192 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	PRR5	P85299	388 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	P2RY6	Q15077	328 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	DECR1	Q16698	335 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	BRF2	Q9HAW0	419 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	PCTP	Q9UKL6	214 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121		A0A087WZY1	265 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	SLC35F4	A4IF30	521 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	KLHL2	O95198	593 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	PGR	P06401	933 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	IL3	P08700	152 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	PYGB	P11216	843 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	ITGAD	Q13349	1161 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	HBM	Q6B0K9	141 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	BANP	Q8N9N5	519 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	RNF128	Q8TEB7	428 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	ABHD3	Q8WU67	409 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	FAM168A	Q92567	244 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	HTRA1	Q92743	480 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LTBP4-233	ENST00000612121	PROX1	Q92786	737 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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