RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 CHPT1Q8WUD6 406 aa20.16■□□□□ 0.82
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PTPRM-211ENST00000580170 LRRC37A3O60309 1634 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 NDUFB2O95178 105 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF100Q8IYN0 542 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 ZFP90Q8TF47 636 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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PTPRM-211ENST00000580170 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
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PTPRM-211ENST00000580170 ASB4Q9Y574 426 aa20.16■□□□□ 0.82
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PTPRM-211ENST00000580170 GPR137CQ8N3F9 429 aa20.16■□□□□ 0.82
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PTPRM-211ENST00000580170 CYB561A3Q8NBI2 242 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa20.15■□□□□ 0.82
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PTPRM-211ENST00000580170 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL15Q96M94 604 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 RDH14Q9HBH5 336 aa20.15■□□□□ 0.82
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PTPRM-211ENST00000580170 SYT7O43581 403 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 SSTR4P31391 388 aa20.15■□□□□ 0.82
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PTPRM-211ENST00000580170 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa20.15■□□□□ 0.82
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PTPRM-211ENST00000580170 LRP6O75581 1613 aa20.14■□□□□ 0.82
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PTPRM-211ENST00000580170 GK3PQ14409 553 aa20.14■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 USP53Q70EK8 1073 aa20.14■□□□□ 0.82
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PTPRM-211ENST00000580170 NEIL2Q969S2 332 aa20.14■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 C3orf30Q96M34 536 aa20.14■□□□□ 0.82
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PTPRM-211ENST00000580170 METTL11BQ5VVY1 283 aa20.14■□□□□ 0.81
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
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PTPRM-211ENST00000580170 MYH3P11055 1940 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 GGT3PA6NGU5 568 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 FRS3O43559 492 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 GCAP28676 217 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 NTSR1P30989 418 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 RAB33AQ14088 237 aa20.14■□□□□ 0.81
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