RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 MKLN1Q9UL63 735 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 NDUFAF1Q9Y375 327 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 PCNX3Q9H6A9 2034 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 LOC100653049A0A140TA62 436 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 A0A1B0GTH9 108 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 GMFGO60234 142 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRAPPC6AO75865 159 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 KRT34O76011 436 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 KRT75O95678 551 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANGPTL1O95841 491 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATP6V1C1P21283 382 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 TBXA2RP21731 343 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 CRATP43155 626 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 GPR68Q15743 365 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 SYPL1Q16563 259 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 C16orf62Q7Z3J2 963 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 HMGN2P46Q86SG4 172 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 C10orf111Q8N326 155 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANKFN1Q8N957 763 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRIM8Q9BZR9 551 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 UBQLN3Q9H347 655 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 MED11Q9P086 117 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABCG2Q9UNQ0 655 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 OSGIN2Q9Y236 505 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 C15orf41Q9Y2V0 281 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 TENM4Q6N022 2769 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 DNAJC13O75165 2243 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 CLIC1O00299 241 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANGPT2O15123 496 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 SOX30O94993 753 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 NUDT7P0C024 238 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 DCTP40126 519 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 TOMM20Q15388 145 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 FLYWCH1Q4VC44 716 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLCZ1Q86YW0 608 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPPL2CQ8IUH8 684 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 GHDCQ8N2G8 530 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ROPN1LQ96C74 230 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZG16BQ96DA0 208 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC6A15Q9H2J7 730 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 DSN1Q9H410 356 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 IKZF5Q9H5V7 419 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 UBQLN4Q9NRR5 601 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 EXD2Q9NVH0 621 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 KCNE5Q9UJ90 142 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 POLEQ07864 2286 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 STX11O75558 287 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 GTF3C1Q12789 2109 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 RGNQ15493 299 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAPK11Q15759 364 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 CD226Q15762 336 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 GPAT3Q53EU6 434 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 EIPR1Q53HC9 387 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATAD3BQ5T9A4 648 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRILQ7L0X0 811 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 SNX32Q86XE0 403 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 POU5F2Q8N7G0 328 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 KLHDC3Q9BQ90 382 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF350Q9GZX5 532 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 LDAHQ9H6V9 325 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLSCR2Q9NRY7 297 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 B4GALT7Q9UBV7 327 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYO18BQ8IUG5 2567 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 MED12Q93074 2177 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 ALG1L2C9J202 215 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 NPIPB9F8W1W9 429 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 CBR3O75828 277 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 H6PDO95479 791 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 AGR2O95994 175 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 IGHG3P01860 377 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 NGFRP08138 427 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHRM4P08173 479 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 HPGDP15428 266 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 CLK3P49761 638 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATP12AP54707 1039 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHRNEQ04844 493 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 SELPLGQ14242 412 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAPK14Q16539 360 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 KLHL26Q53HC5 615 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 FRRS1Q6ZNA5 592 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 PIGWQ7Z7B1 504 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 DHDDSQ86SQ9 333 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms