RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562602.1

CFDP1-202, Transcript of craniofacial development protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CFDP1, Length 699 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1-202ENST00000562602 NDEL1Q9GZM8 345 aa7□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 SERHL2Q9H4I8 314 aa7□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 NIPAL2Q9H841 368 aa7□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 SFXN1Q9H9B4 322 aa7□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 FOLH1BQ9HBA9 442 aa7□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 DZANK1Q9NVP4 752 aa7□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 ING3Q9NXR8 418 aa7□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 CBLCQ9ULV8 474 aa7□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 SCML1Q9UN30 329 aa7□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 SLC6A14Q9UN76 642 aa7□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 SATB2Q9UPW6 733 aa7□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 A0A087WV62 115 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 ANTXRLA6NF34 631 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 UNC119BA6NIH7 251 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 PRR19A6NJB7 356 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 PLD2O14939 933 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 SURF4O15260 269 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 KLF4O43474 513 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 SLC43A1O75387 559 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 ITGA10O75578 1167 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 AIFM1O95831 613 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 SERPINA3P01011 423 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 DBIP07108 87 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 ASGR2P07307 311 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 CSF3P09919 207 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 SLC35G6P0C7Q6 338 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 MSL3P1P0C860 447 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 LIMS3P0CW19 117 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 LIMS4P0CW20 117 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 PEPDP12955 493 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 ACP5P13686 325 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 BMP7P18075 431 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 IL12RB1P42701 662 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 GJA8P48165 433 aa6.99□□□□□ -1.29
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CFDP1-202ENST00000562602 EVX1P49640 407 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 GAS1P54826 345 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 ERVK-21P61565 698 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 ACTC1P68032 377 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 ACTA1P68133 377 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 CD300CQ08708 224 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 DUSP8Q13202 625 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 LRRC32Q14392 662 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 KIR2DS3Q14952 304 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 CDK10Q15131 360 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 IRF4Q15306 451 aa6.99□□□□□ -1.29
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CFDP1-202ENST00000562602 SDE2Q6IQ49 451 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 ZNF425Q6IV72 752 aa6.99□□□□□ -1.29
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CFDP1-202ENST00000562602 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 TEX19Q8NA77 164 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 ZNF485Q8NCK3 441 aa6.99□□□□□ -1.29
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CFDP1-202ENST00000562602 OR52E1Q8NGJ3 308 aa6.99□□□□□ -1.29
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CFDP1-202ENST00000562602 ZNF681Q96N22 645 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 LRRC3BQ96PB8 259 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 STACQ99469 402 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 MCHR1Q99705 422 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 ABCG4Q9H172 646 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 SLC38A1Q9H2H9 487 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 TPK1Q9H3S4 243 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 KCNK12Q9HB15 430 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 LYRM4Q9HD34 91 aa6.99□□□□□ -1.29
CFDP1-202ENST00000562602 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.99□□□□□ -1.29
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