RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557696.5

CLMN-209, Transcript of calmin, humanhuman

TSL 2

Gene CLMN, Length 746 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMN-209ENST00000557696 OPN5Q6U736 354 aa9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 IL20RBQ6UXL0 311 aa9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 CYP2R1Q6VVX0 501 aa9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 LINC00696Q6ZRV3 163 aa9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 KRT73Q86Y46 540 aa9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 ZNF619Q8N2I2 560 aa9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 TMEM156Q8N614 296 aa9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 FDCSPQ8NFU4 85 aa9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 AGAP4Q96P64 663 aa9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 ZNF607Q96SK3 696 aa9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 MUC13Q9H3R2 512 aa9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 BCL2L10Q9HD36 194 aa9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 HPF1Q9NWY4 346 aa9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 STMN3Q9NZ72 180 aa9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 POMPQ9Y244 141 aa9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 DSPPQ9NZW4 1301 aa9.01□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 CFAP73A6NFT4 308 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 M0QX08 132 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 ACOT8O14734 319 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 ICOSLGO75144 302 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 SERPINB7O75635 380 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 UGT2B17O75795 530 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 F10P00742 488 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 SERPINA1P01009 418 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 GUSBP08236 651 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 ETS2P15036 469 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 HPGDP15428 266 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 ATP6V1B2P21281 511 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 LCN1P31025 176 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 DCTP40126 519 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 CASRP41180 1078 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 POLE2P56282 527 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 MFAP5Q13361 173 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 EFR3AQ14156 821 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 FLOT2Q14254 428 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 NTRK2Q16620 822 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 GRAMD1BQ3KR37 738 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 C1orf146Q5VVC0 180 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 BORAQ6PGQ7 559 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 ISLR2Q6UXK2 745 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 CCDC80Q76M96 950 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 DHFR2Q86XF0 187 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 SPPL2CQ8IUH8 684 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 ZNF614Q8N883 585 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 FAM13CQ8NE31 585 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 OR10G3Q8NGC4 313 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 OR4C3Q8NH37 302 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 SPPL2AQ8TCT8 520 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 SLC26A7Q8TE54 656 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 HGDQ93099 445 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 ZG16BQ96DA0 208 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 TMCO6Q96DC7 493 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 LRGUKQ96M69 825 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 NSMCE2Q96MF7 247 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 FLRT3Q9NZU0 649 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 ACTR3BQ9P1U1 418 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 NCOR2Q9Y618 2525 aa9□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 AGAP5A6NIR3 686 aa8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 SCDO00767 359 aa8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 TP53I11O14683 189 aa8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 LILRA1O75019 489 aa8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 CEACAM4O75871 244 aa8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 MFN2O95140 757 aa8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 ZNF682O95780 498 aa8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 WDPCPO95876 746 aa8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 IFNA14P01570 189 aa8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 PDGFAP04085 211 aa8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 DBIP07108 87 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 CYB561P49447 251 aa8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 ERFP50548 548 aa8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 HLCSP50747 726 aa8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 CRYBA2P53672 197 aa8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 ATP12AP54707 1039 aa8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 TUBA3CQ13748 450 aa8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 ZNF141Q15928 474 aa8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 MAPK14Q16539 360 aa8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 TBR1Q16650 682 aa8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 LIN52Q52LA3 116 aa8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 ZNF311Q5JNZ3 666 aa8.99□□□□□ -0.97
CLMN-209ENST00000557696 PDZK1Q5T2W1 519 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms