RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557168.1

TRAV30-201, Transcript of T cell receptor alpha variable 30, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRAV30, Length 337 nt, Biotype TR V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV30-201ENST00000557168 SCARB2Q14108 478 aa4.64□□□□□ -1.67
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TRAV30-201ENST00000557168 ARHGAP19Q14CB8 494 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 NCF4Q15080 339 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 CDSNQ15517 529 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 BCL2A1Q16548 175 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TIGD6Q17RP2 521 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 PRSS53Q2L4Q9 553 aa4.64□□□□□ -1.67
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TRAV30-201ENST00000557168 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP4.64□□□□□ -1.67
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TRAV30-201ENST00000557168 FADS2O95864 444 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
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TRAV30-201ENST00000557168 ADAP00813 363 aa4.63□□□□□ -1.67
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TRAV30-201ENST00000557168 PRIM2P49643 509 aa4.63□□□□□ -1.67
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TRAV30-201ENST00000557168 SMIM11AP58511 58 aa4.63□□□□□ -1.67
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TRAV30-201ENST00000557168 COPZ1P61923 177 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 EFNB1P98172 346 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ST3GAL4Q11206 333 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 COX10Q12887 443 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 GPR18Q14330 331 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP4.63□□□□□ -1.67
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