RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 EQTNQ9NQ60 294 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 SLC17A7Q9P2U7 560 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 PACSIN3Q9UKS6 424 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 TRAF6Q9Y4K3 522 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 SLC22A20A6NK97 555 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 TMEM233B4DJY2 109 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 H3BML4 177 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 NUDT17P0C025 328 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 ACP2P11117 423 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 BCKDHAP12694 445 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 CLDN20P56880 219 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 TMEM44Q2T9K0 475 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 GALNTL6Q49A17 601 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 VPS26BQ4G0F5 336 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 OR2A2Q6IF42 318 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 ZFP28Q8NHY6 868 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 TWIST2Q8WVJ9 160 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 SLC9A6Q92581 669 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 MBD6Q96DN6 1003 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 MTERF3Q96E29 417 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 LGALS13Q9UHV8 139 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 EDARQ9UNE0 448 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 SH3D21A4FU49 640 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 SHISA8B8ZZ34 492 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 ALG1L2C9J202 215 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 MSTNO14793 375 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 PIP5K1BO14986 540 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 SEC14L5O43304 696 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 EMC8O43402 210 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 SPAG7O75391 227 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 HRGP04196 525 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 CD99P14209 185 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 ASMTP46597 345 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 VSNL1P62760 191 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 FAM27E3Q08E93 113 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 MLC1Q15049 377 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 FBXW10Q5XX13 1052 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 PAMR1Q6UXH9 720 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 CAMKMTQ7Z624 323 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 BTLAQ7Z6A9 289 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 GALNT10Q86SR1 603 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 DDIASQ8IXT1 998 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 METTL25Q8N6Q8 603 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 SLC16A11Q8NCK7 471 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 OR4C3Q8NH37 302 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 TCP10LQ8TDR4 215 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 C16orf58Q96GQ5 468 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 YIPF4Q9BSR8 244 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 PINK1Q9BXM7 581 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 FBXO34Q9NWN3 711 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 GIMAP2Q9UG22 337 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 ATP6V1HQ9UI12 483 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 AP4B1Q9Y6B7 739 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 ZFHX3Q15911 3703 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 A0A1W2PPR1 153 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 GMFGO60234 142 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 KCNK2O95069 426 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 ATE1O95260 518 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 CGAP01215 116 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 RAF1P04049 648 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 NGFRP08138 427 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 CREB1P16220 341 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 TBXA2RP21731 343 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 ARRB2P32121 409 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 PCYT1AP49585 367 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 OCRLQ01968 901 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 DUSP5Q16690 384 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 XKR7Q5GH72 579 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 MFSD12Q6NUT3 480 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 FIGNL1Q6PIW4 674 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 LRIG3Q6UXM1 1119 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 ZAR1Q86SH2 424 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 OR6Y1Q8NGX8 325 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 FBXO30Q8TB52 745 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 PGM2Q96G03 612 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 C3orf30Q96M34 536 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 MS4A4EQ96PG1 132 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 ALPK1Q96QP1 1244 aa13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms