RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 RFX3P48380 749 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 TMED10P49755 219 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 UFM1P61960 85 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 RBPJQ06330 500 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 SLC10A1Q14973 349 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 C3AR1Q16581 482 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 CMPK2Q5EBM0 449 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 TMEM198Q66K66 360 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 OR4F3Q6IEY1 312 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 MAVSQ7Z434 540 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 SLC22A16Q86VW1 577 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 SPPL2CQ8IUH8 684 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 TMEM251Q8N6I4 163 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 FBXO30Q8TB52 745 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
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CS-217ENST00000550044 NRGNQ92686 78 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 HGDQ93099 445 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 C16orf58Q96GQ5 468 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 TEX37Q96LM6 180 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 RILPQ96NA2 401 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 BTBD9Q96Q07 612 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 ANGPTL4Q9BY76 406 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 METTL7AQ9H8H3 244 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 IL1RL2Q9HB29 575 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 C3orf14Q9HBI5 128 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 ATAD3AQ9NVI7 634 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 ASIC5Q9NY37 505 aa8.8□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 VPS13CQ709C8 3753 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 C9JVG2 144 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 ZNF195O14628 629 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 ANKRD28O15084 1053 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 EMC8O43402 210 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 TSPAN2O60636 221 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 ICOSLGO75144 302 aa8.79□□□□□ -1
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CS-217ENST00000550044 ABOP16442 354 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 IL12BP29460 328 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 GIPRP48546 466 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 CCT3P49368 545 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 IST1P53990 364 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 WNT3P56703 355 aa8.79□□□□□ -1
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CS-217ENST00000550044 PHC1P78364 1004 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 LTBQ06643 244 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 MLC1Q15049 377 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 OGFOD2Q6N063 350 aa8.79□□□□□ -1
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CS-217ENST00000550044 Q71RC1 249 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 SPATA19Q7Z5L4 167 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 FGD2Q7Z6J4 655 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 GALNT10Q86SR1 603 aa8.79□□□□□ -1
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CS-217ENST00000550044 CLECL1Q8IZS7 167 aa8.79□□□□□ -1
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CS-217ENST00000550044 OR5P2Q8WZ92 322 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 PIK3R3Q92569 461 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 TMCO6Q96DC7 493 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 CHMP6Q96FZ7 201 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 MARK4Q96L34 752 aa8.79□□□□□ -1
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CS-217ENST00000550044 GNRHR2Q96P88 292 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 OR52B2Q96RD2 323 aa8.79□□□□□ -1
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CS-217ENST00000550044 ENKD1Q9H0I2 346 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 CXorf36Q9H7Y0 433 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 GALNT9Q9HCQ5 603 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 CBLCQ9ULV8 474 aa8.79□□□□□ -1
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CS-217ENST00000550044 RNF114Q9Y508 228 aa8.79□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 USH1CQ9Y6N9 552 aa8.79□□□□□ -1
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CS-217ENST00000550044 OR6C70A6NIJ9 312 aa8.78□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 LRRC3CA6NJW4 275 aa8.78□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 TRAPPC6AO75865 159 aa8.78□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 SNX4O95219 450 aa8.78□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 PSMG1O95456 288 aa8.78□□□□□ -1
CS-217ENST00000550044 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
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