RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 MAP3K8P41279 467 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 DNASE1L1P49184 302 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 CCT3P49368 545 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 NRG3P56975 720 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 PRR5P85299 388 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 PSG6Q00889 435 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC10A1Q14973 349 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 POU4F3Q15319 338 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 CT45A2Q5DJT8 189 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 BHLHB9Q6PI77 547 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 LYPD8Q6UX82 237 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 GK5Q6ZS86 529 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 TRILQ7L0X0 811 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 SPATA21Q7Z572 469 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 CPLX4Q7Z7G2 160 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 FUNDC1Q8IVP5 155 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 CLECL1Q8IZS7 167 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 TAGAPQ8N103 731 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM109AQ8N4B1 249 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM251Q8N6I4 163 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 OR56A1Q8NGH5 318 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 OR4A15Q8NGL6 344 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM222BQ8WU58 562 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 TSPEARQ8WU66 669 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 SARAFQ96BY9 339 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 GIMAP5Q96F15 307 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 SGCZQ96LD1 299 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 MS4A4EQ96PG1 132 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 OR52E6Q96RD3 313 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 GAL3ST4Q96RP7 486 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 ITPAQ9BY32 194 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 CXorf36Q9H7Y0 433 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 RMND5AQ9H871 391 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 FOLH1BQ9HBA9 442 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 GIN1Q9NXP7 522 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 CCDC167Q9P0B6 97 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 B4GALT7Q9UBV7 327 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 DTX4Q9Y2E6 619 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 ABCA2Q9BZC7 2435 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 ABCA4P78363 2273 aa7.95□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 CCDC154A6NI56 674 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 CAPN14A8MX76 684 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 AQP7O14520 342 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 DVL2O14641 736 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC22A2O15244 555 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 FBXO45P0C2W1 286 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 ZCCHC18P0CG32 403 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 CNR1P21554 472 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 UQCRC2P22695 453 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 HOXC12P31275 282 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 SOX3P41225 446 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 PRIM2P49643 509 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 ASCL1P50553 236 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 NTRK2Q16620 822 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 VPS26BQ4G0F5 336 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 AGKQ53H12 422 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 MFSD12Q6NUT3 480 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 ANKRD46Q86W74 232 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 TRIML2Q8N7C3 387 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 CDRT4Q8N9R6 151 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 SPDL1Q96EA4 605 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 ARSGQ96EG1 525 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 ITCHQ96J02 903 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 PANX1Q96RD7 426 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM173AQ9BQD7 235 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 YIPF4Q9BSR8 244 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 IL1RL2Q9HB29 575 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC52A3Q9NQ40 469 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 SERHLQ9NQF3 203 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 SAR1AQ9NR31 198 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 GPATCH2Q9NW75 528 aa7.94□□□□□ -1.14
CLSTN3-212ENST00000541770 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms