RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCSK2P16519 638 aa8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EDNRAP25101 427 aa8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BSGP35613 385 aa8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EMDP50402 254 aa8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CARD18P57730 90 aa8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBA52P62987 128 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MST1LQ2TV78 715 aa8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.94□□□□□ -0.98
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MARCH3Q86UD3 253 aa8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD49Q8WVL7 239 aa8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBE2E3Q969T4 207 aa8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADGRG7Q96K78 797 aa8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SUCNR1Q9BXA5 334 aa8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLHL13Q9P2N7 655 aa8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRODH2Q9UF12 536 aa8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPEF1Q9Y4P9 236 aa8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BIRC6Q9NR09 4857 aa8.94□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCNX3Q9H6A9 2034 aa8.93□□□□□ -0.98
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GOLGA8OA6NCC3 632 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5H1A6NKK0 313 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 B4DSR2 109 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GOLGA8NF8WBI6 632 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GOLGA8RI6L899 631 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BCL10O95999 233 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TACSTD2P09758 323 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CT45A8P0DMV1 189 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CT45A9P0DMV2 189 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DAOP14920 347 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV1-2P23083 117 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SFTPDP35247 375 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RFX3P48380 749 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PNLIPRP2P54317 469 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CT45A2Q5DJT8 189 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM45BPQ6NSW5 357 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPSR1Q6W5P4 371 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q6ZT83 130 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNGA4Q8IV77 575 aa8.93□□□□□ -0.98
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LAS2Q8IYD9 372 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM58Q8NG06 486 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM110BQ8TC76 370 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM45AQ8TCE6 357 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC9A6Q92581 669 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EXT2Q93063 718 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM186Q96B77 213 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC37BQ96QE4 947 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSPY26PQ9H489 355 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10H1Q9Y4A9 318 aa8.93□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa8.92□□□□□ -0.98
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LYNX1G3V0Z9 82 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADAMDEC1O15204 470 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FADS1O60427 444 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3-9P01782 118 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 YES1P07947 543 aa8.92□□□□□ -0.98
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFNGR1P15260 489 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PGCP20142 388 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPX6P59796 221 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRYMQ14894 314 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCNG2Q16589 344 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDSS1Q5T2R2 415 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPATA19Q7Z5L4 167 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUDT13Q86X67 352 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TDRPQ86YL5 185 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VSTM4Q8IW00 320 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BPIFB2Q8N4F0 458 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF128Q8TEB7 428 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF138Q8WVD3 245 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC1Q9BTT6 524 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRXN1Q9BYN0 137 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
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