RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 SDC1P18827 310 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 CYP3A5P20815 502 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 ADORA2BP29275 332 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 SAA4P35542 130 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 CXCL5P42830 114 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 RPL29P47914 159 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 MAMLD1Q13495 774 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 P2RY14Q15391 338 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 CACNA1EQ15878 2313 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 HKDC1Q2TB90 917 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 RAB41Q5JT25 222 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 IL23RQ5VWK5 629 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 CASP12Q6UXS9 341 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF621Q6ZSS3 439 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 APCDD1Q8J025 514 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 MINDY1Q8N5J2 469 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR52I1Q8NGK6 324 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 NCOA7Q8NI08 942 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 RNF139Q8WU17 664 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 CKAP2Q8WWK9 683 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 PSMG2Q969U7 264 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 PCED1BQ96HM7 432 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF416Q9BWM5 594 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 TSPY26PQ9H489 355 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 PLEK2Q9NYT0 353 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF226Q9NYT6 803 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPRR3Q9UBC9 169 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 FGD5Q6ZNL6 1462 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 GLSO94925 669 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 SCGB1D1O95968 90 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 GSTA2P09210 222 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 GIPP09681 153 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 GCKP35557 465 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 PSMB10P40306 273 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 RGS7P49802 495 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 STAT2P52630 851 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 CSNK1G2P78368 415 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 PSMD6Q15008 389 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 CYP51A1Q16850 503 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM183BQ1AE95 376 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 DCAF12Q5T6F0 453 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPATA8Q6RVD6 105 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 MAATS1Q7Z4T9 603 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 NRARPQ7Z6K4 114 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 WDR86Q86TI4 376 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 KBTBD6Q86V97 674 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 VRK2Q86Y07 508 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM183AQ8IXX5 376 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 C15orf56Q8N910 161 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPATA33Q96N06 139 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 MAGT1Q9H0U3 335 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 FN3KQ9H479 309 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 AIG1Q9NVV5 245 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 LHX3Q9UBR4 397 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF639Q9UID6 485 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 ASF1AQ9Y294 204 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 L3MBTL1Q9Y468 752 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZBED9Q6R2W3 1325 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 A0A0B4J203 849 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCDC162PA2VCL2 907 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 HELTA6NFD8 242 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 S1PR2O95136 353 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 KLHL2O95198 593 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 CALCAP01258 141 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRT14P02533 472 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 FCER2P06734 321 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 CD55P08174 381 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 TDGF1P13385 188 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 AQP1P29972 269 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 TM4SF1P30408 202 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 GDI2P50395 445 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 TDGF1P3P51864 188 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 NRF1Q16656 503 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 XKR7Q5GH72 579 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms