RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 HLA-DQA2P01906 255 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 RAF1P04049 648 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ALPLP05186 524 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 UBBP0CG47 229 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 HSMCR30P0CW71 290 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ACP2P11117 423 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 BMP1P13497 986 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 GKP32189 559 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 BCL6P41182 706 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 GPR176Q14439 515 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ACTBL2Q562R1 376 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 NXNL2Q5VZ03 156 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PLAG1Q6DJT9 500 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 SYCE2Q6PIF2 218 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 SMARCD3Q6STE5 483 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 SUSD1Q6UWL2 747 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 CCDC103Q8IW40 242 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 CCDC36Q8IYA8 594 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 OR9I1Q8NGQ6 314 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ZFYVE19Q96K21 471 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 CXCL16Q9H2A7 254 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 CPNE5Q9HCH3 593 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 KLRF1Q9NZS2 232 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 VAPAQ9P0L0 249 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 hCG_2039718K7EN88 272 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 SCAMP1O15126 338 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 MOSPD3O75425 235 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ATG12O94817 140 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 LGI1O95970 557 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 TP53P04637 393 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 NID1P14543 1247 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 CD36P16671 472 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 S1PR1P21453 382 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 TSPAN7P41732 249 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 WNT4P56705 351 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PHC1P78364 1004 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 SEMG2Q02383 582 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ZNF528Q3MIS6 628 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 DEFB134Q4QY38 66 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 KLHL12Q53G59 568 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 CES4AQ5XG92 561 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 FCRL6Q6DN72 434 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 AHSA2Q719I0 299 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 SYS1Q8N2H4 156 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ARL14Q8N4G2 192 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 LRRC17Q8N6Y2 441 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 POGLUT1Q8NBL1 392 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ELP4Q96EB1 424 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 SLC30A3Q99726 388 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 WDR54Q9H977 334 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 CERS4Q9HA82 394 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 EQTNQ9NQ60 294 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 TVP23BQ9NYZ1 205 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ZNF639Q9UID6 485 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 WIF1Q9Y5W5 379 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ETV7Q9Y603 341 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 A0A0A6YYH2 397 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 SERINC4A6NH21 518 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 A6NHS1 94 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 A6NJ64 397 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PRRT4C9JH25 899 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 B4GALT3O60512 393 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 DLGAP3O95886 979 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PTTG1O95997 202 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 CDK1P06493 297 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 RAB40ALP0C0E4 278 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 OR2T7P0C7T2 308 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 BSGP35613 385 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 XCR1P46094 333 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PDX1P52945 283 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 CASP6P55212 293 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 NXPH1P58417 271 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 RAB8AP61006 207 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PLP2Q04941 152 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 SIGLEC14Q08ET2 396 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PMS2P3Q13401 168 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 GPR68Q15743 365 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 PAGE3Q5JUK9 113 aa5.47□□□□□ -1.53
POLK-215ENST00000514141 GPR107Q5VW38 600 aa5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms