RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512656.1

USP46-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

TSL 3

Gene USP46, Length 467 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-208ENST00000512656 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 LUZP2Q86TE4 346 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 BIVMQ86UB2 503 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 LCA5Q86VQ0 697 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 WDSUB1Q8N9V3 476 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 MNS1Q8NEH6 495 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 FBXO27Q8NI29 283 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 RDH11Q8TC12 318 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 METTL6Q8TCB7 284 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 IFT81Q8WYA0 676 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 SMPDL3BQ92485 455 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 TMBIM1Q969X1 311 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 MTBPQ96DY7 904 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 ZNF681Q96N22 645 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 SFXN2Q96NB2 322 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 BBS4Q96RK4 519 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 ZNF382Q96SR6 550 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 ADOQ96SZ5 270 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 TAS2R9Q9NYW1 312 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 EHD3Q9NZN3 535 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 GPR160Q9UJ42 338 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 PACSIN3Q9UKS6 424 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 WIF1Q9Y5W5 379 aa6.51□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 MED12Q93074 2177 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 SH3D21A4FU49 640 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 PLOD2O00469 737 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 ARHGEF9O43307 516 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 PLOD3O60568 738 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 COQ9O75208 318 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 URI1O94763 535 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 OR4F21O95013 312 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 IL3P08700 152 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 PEPDP12955 493 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 TSPAN8P19075 237 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 GRK2P25098 689 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 DPP4P27487 766 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 PTGDSP41222 190 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 SLCO1A2P46721 670 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 PCYT1AP49585 367 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 LHX2P50458 406 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 PNLIPRP2P54317 469 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 PKNOX1P55347 436 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 GFRA1P56159 465 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 ADAM8P78325 824 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 FOXF2Q12947 444 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 FGFBP1Q14512 234 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 LTB4RQ15722 352 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 ZNF628Q5EBL2 1059 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 ZNF678Q5SXM1 525 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 P4HA3Q7Z4N8 544 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 SLC22A9Q8IVM8 553 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 MMP21Q8N119 569 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 DCAKDQ8WVC6 231 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 KAT2AQ92830 837 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 VSTM2LQ96N03 204 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 HBEGFQ99075 208 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 HHATLQ9HCP6 504 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 GALNT8Q9NY28 637 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 CLCF1Q9UBD9 225 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 HEY2Q9UBP5 337 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 ZANQ9Y493 2812 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 NCKAP5O14513 1909 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 DOCK7Q96N67 2140 aa6.49□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 VPS13CQ709C8 3753 aa6.49□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 A0A1B0GTL3 188 aa6.49□□□□□ -1.37
USP46-208ENST00000512656 A0A1W2PNV4 684 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms