RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 PRKD3O94806 890 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 MAGEA8P43361 318 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 PDLIM4P50479 330 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 MAPK12P53778 367 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 PKNOX1P55347 436 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 PPP1R7Q15435 360 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 TIFABQ6ZNK6 161 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 TMBIM1Q969X1 311 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 ZIM3Q96PE6 472 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 OR51B5Q9H339 312 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 ALKBH4Q9NXW9 302 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 FKBP7Q9Y680 259 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 MED12LQ86YW9 2145 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 NBASA2RRP1 2371 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 B4DXG7 233 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 PDLIM1O00151 329 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 YES1P07947 543 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 DHRS4L1P0CG22 281 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 DDCP20711 480 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 MPIP34949 423 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SERPINB8P50452 374 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SERPINB9P50453 376 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 PSG6Q00889 435 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 IRF9Q00978 393 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 OR7E24Q6IFN5 339 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 FBXO36Q8NEA4 188 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 FBXO30Q8TB52 745 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 MOAP1Q96BY2 351 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 KLHL15Q96M94 604 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 MUS81Q96NY9 551 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 KCNS2Q9ULS6 477 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 RNF223E7ERA6 249 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 LINGO3P0C6S8 592 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 CASP9P55211 416 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 DLG1Q12959 904 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 VEZF1Q14119 521 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SH2D4BQ5SQS7 431 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 COMMD6Q7Z4G1 85 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 OR52B6Q8NGF0 335 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 L3HYPDHQ96EM0 354 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 HS6ST2Q96MM7 605 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 Q9N2J8 555 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 OR6C65A6NJZ3 312 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 RTCAO00442 366 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 WNT3P56703 355 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 RAC3P60763 192 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 PHC1P78364 1004 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SELENBP1Q13228 472 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SLC29A2Q14542 456 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 RASA2Q15283 850 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 BICRALQ6AI39 1079 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM64Q6YI46 380 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 TEX9Q8N6V9 391 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 NUP37Q8NFH4 326 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 ST8SIA1Q92185 356 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 MTBPQ96DY7 904 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 FAM111AQ96PZ2 611 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 DSN1Q9H410 356 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 KLHL9Q9P2J3 617 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1W2PP18 115 aa6.84□□□□□ -1.31
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