RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 DLG1Q12959 904 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ZFP1Q6P2D0 407 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 C16orf89Q6UX73 402 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF605Q86T29 641 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 DHFR2Q86XF0 187 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CACUL1Q86Y37 369 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PRSS58Q8IYP2 241 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ALG3Q92685 438 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SLC35C1Q96A29 364 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CCDC120Q96HB5 630 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NSL1Q96IY1 281 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RNF170Q96K19 258 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 DDOQ99489 341 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 HDHD5Q9BXW7 423 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PCBD2Q9H0N5 130 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 C1orf198Q9H425 327 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 EBF3Q9H4W6 596 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CDH20Q9HBT6 801 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ANKHQ9HCJ1 492 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RAB18Q9NP72 206 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ASB6Q9NWX5 421 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 C1orf109Q9NX04 203 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TNNQ9UQP3 1299 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PNPLA6Q8IY17 1366 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM82A0PJX8 343 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 C1orf226A1L170 272 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 HYKKA2RU49 373 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 C5orf60A6NFR6 353 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 HEPACAM2A8MVW5 462 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ADM5C9JUS6 153 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CLDN34H7C241 214 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SURF4O15260 269 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 INPP4BO15327 924 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RNMTO43148 476 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 GMDSO60547 372 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PRAF2O60831 178 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SH3BGRLO75368 114 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 BCAR3O75815 825 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 BRI3O95415 125 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 AMHP03971 560 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 COX4I1P13073 169 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CFHR2P36980 270 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 AVPR1AP37288 418 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SLCO1A2P46721 670 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 GABRA4P48169 554 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RAB10P61026 200 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 JAG1P78504 1218 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 HHEXQ03014 270 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 DUSP2Q05923 314 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PIGFQ07326 219 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 GRB7Q14451 532 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PTGR1Q14914 329 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM132DQ14C87 1099 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TCTN1Q2MV58 587 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 C9orf135Q5VTT2 229 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SDHAF4Q5VUM1 108 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ACSM6Q6P461 480 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 C3P1Q6ZMU1 363 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 FCRLAQ7L513 359 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NAXDQ8IW45 347 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM156Q8N614 296 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms