RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496569.1

HDLBP-246, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene HDLBP, Length 374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-246ENST00000496569 DUSP19Q8WTR2 217 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 SMPDL3BQ92485 455 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 MTERF3Q96E29 417 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 ARSGQ96EG1 525 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 NTMQ9P121 344 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 RAP2CQ9Y3L5 183 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 H3BML4 177 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 BIRC5O15392 142 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 CFLARO15519 480 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 SEC14L5O43304 696 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 OIP5O43482 229 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 ZWINTO95229 277 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 ANGPTL1O95841 491 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 ACTL6AO96019 429 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 UQCRC1P31930 480 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 DGKQP52824 942 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 NME5P56597 212 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 CLDN15P56746 228 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 MYBPHQ13203 477 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 STX3Q13277 289 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 NDUFAF6Q330K2 333 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 FREM1Q5H8C1 2179 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 HHATQ5VTY9 493 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 ARSKQ6UWY0 536 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 LRIG3Q6UXM1 1119 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 ANKRD46Q86W74 232 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 PM20D2Q8IYS1 436 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 COX18Q8N8Q8 333 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 CDRT4Q8N9R6 151 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 OR5D16Q8NGK9 328 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 CEP70Q8NHQ1 597 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 NRGNQ92686 78 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 PGM2Q96G03 612 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 SH3GL2Q99962 352 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 SERHL2Q9H4I8 314 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 RUBCNLQ9H714 662 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 C3orf14Q9HBI5 128 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 CLCF1Q9UBD9 225 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 ABCG2Q9UNQ0 655 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 VDAC3Q9Y277 283 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 L3MBTL1Q9Y468 752 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 F8P00451 2351 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 OR2M5A3KFT3 312 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 CD8B2A6NJW9 211 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 HSPB2A8KAH6 182 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 TGM6O95932 706 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 IL2RAP01589 272 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 OPN1LWP04000 364 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 IFI6P09912 130 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 ALOX5P09917 674 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 MYZAPP0CAP1 466 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 KITP10721 976 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF708P17019 499 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 GCKP35557 465 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 CCT3P49368 545 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 RPL14P50914 215 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 CLDN20P56880 219 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 HBA1P69905 142 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 PHC1P78364 1004 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 EMX2Q04743 252 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 RCAN2Q14206 197 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 CD226Q15762 336 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 HSPB2Q16082 182 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 SPDYE7PQ495Y7 208 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 ENPP6Q6UWR7 440 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 ZZZ3Q8IYH5 903 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 FAM110BQ8TC76 370 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 OR5P2Q8WZ92 322 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 COQ8BQ96D53 544 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 MARK4Q96L34 752 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 DUSP26Q9BV47 211 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 GPATCH2Q9NW75 528 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-246ENST00000496569 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms