RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495217.1

PRDM15-215, Transcript of PR/SET domain 15, human

TSL 3

Gene PRDM15, Length 703 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRDM15-215	ENST00000495217	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	ADGRG7	Q96K78	797 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	CCDC151	A5D8V7	595 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	KLF4	O43474	513 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	ANGPTL1	O95841	491 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	ABHD2	P08910	425 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	PPP3CB	P16298	524 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	RFX3	P48380	749 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	PRR5	P85299	388 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	BTK	Q06187	659 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	C2orf80	Q0P641	193 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	ELP4	Q96EB1	424 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	ROS1	P08922	2347 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	ATR	Q13535	2644 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	C7orf72	A4D263	438 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	ALG1L2	C9J202	215 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	GMFG	O60234	142 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	MAP3K8	P41279	467 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	NR1H2	P55055	460 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	ZNF844	Q08AG5	666 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	SGCB	Q16585	318 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	OR10D3	Q8NH80	312 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	IFT81	Q8WYA0	676 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	NPAS1	Q99742	590 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	VDAC3	Q9Y277	283 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	STAB1	Q9NY15	2570 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	TTC36	A6NLP5	189 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	HS3ST1	O14792	307 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	ADAMDEC1	O15204	470 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	TMCC2	O75069	709 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	KCNH1	O95259	989 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	PLAU	P00749	431 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	NGFR	P08138	427 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	IL11	P20809	199 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	GABRA3	P34903	492 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	PPP2R2B	Q00005	443 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	GALNT10	Q86SR1	603 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	ZNF611	Q8N823	705 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	PIK3R3	Q92569	461 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	SLC9A6	Q92581	669 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	EQTN	Q9NQ60	294 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	EMCN	Q9ULC0	261 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PRDM15-215	ENST00000495217		A0A087WZY1	265 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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