RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 HTR1EP28566 365 aa17.54■□□□□ 0.4
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SH3BP4-209ENST00000484097 EPPINO95925 133 aa17.5■□□□□ 0.39
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SH3BP4-209ENST00000484097 AK1P00568 194 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-209ENST00000484097 IL6P05231 212 aa17.5■□□□□ 0.39
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