RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481739.1

RXRA-202, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RXRA, Length 1,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-202ENST00000481739 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.66□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 U3KQA8 63 aa14.66□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 MYO15AQ9UKN7 3530 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 A0A1W2PPW3 197 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 A8MU76 341 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 BRINP1O60477 761 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 BCL10O95999 233 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 PNLIPP16233 465 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 PSMB9P28065 219 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 TSPAN31Q12999 210 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 SLC13A2Q13183 592 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 ZNF730Q6ZMV8 503 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 CCDC81Q6ZN84 652 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 MED25Q71SY5 747 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 P2RY8Q86VZ1 359 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 GPR151Q8TDV0 419 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 ZG16BQ96DA0 208 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 YIPF6Q96EC8 236 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 MVB12AQ96EY5 273 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 MCHR1Q99705 422 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 CDCA4Q9BXL8 241 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 ITPAQ9BY32 194 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 SLC25A19Q9HC21 320 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 C14orf105Q9NVL8 296 aa14.65□□□□□ -0.06
RXRA-202ENST00000481739 A0A087WUU8 490 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 CLDN24A6NM45 220 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 CBX7O95931 251 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 CSF2RBP32927 897 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 MAP2K4P45985 399 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 SMSP52788 366 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 CFHR1Q03591 330 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 SERTAD2Q14140 314 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 OCLNQ16625 522 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 ZNF836Q6ZNA1 936 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 CLIP4Q8N3C7 705 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 NAT6Q93015 286 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 SLC35B4Q969S0 331 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 NUDT22Q9BRQ3 303 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 TEX12Q9BXU0 123 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 NINQ8N4C6 2090 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 ZNF318Q5VUA4 2279 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 PRAMEF2O60811 474 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 FPR3P25089 353 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 CCL7P80098 99 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 PLA2G2CQ5R387 149 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 TMEM236Q5W0B7 351 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 OR52R1Q8NGF1 315 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 RIT1Q92963 219 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 DTNBP1Q96EV8 351 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 SLC41A3Q96GZ6 507 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 RACGAP1Q9H0H5 632 aa14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 SNTNA6NMZ2 147 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 TPST2O60704 377 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 SOX14O95416 240 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 CTSBP07858 339 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 CT62P0C5K7 136 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 MSL3P1P0C860 447 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 GABRA3P34903 492 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 STAT5AP42229 794 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 SLC15A1P46059 708 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 STT3AP46977 705 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 GIPRP48546 466 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 HSD11B2P80365 405 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 CDK5Q00535 292 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 ST3GAL4Q11206 333 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 IRF3Q14653 427 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 KCNAB1Q14722 419 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 GPR68Q15743 365 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 CTF1Q16619 201 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 HMGN2P46Q86SG4 172 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 KMT5CQ86Y97 462 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 SIMC1Q8NDZ2 872 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 B3GNT7Q8NFL0 401 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 TEX47Q8TBZ9 253 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 IFI44Q8TCB0 444 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 DGAT2Q96PD7 388 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.6 ms