RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 PPIAL4EA0A075B759 164 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 G3V4G9 280 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 MSH4O15457 936 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGEF9O43307 516 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNAB3O43448 404 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 MAGEC1O60732 1142 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 CRYGBP07316 175 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 ALOX5P09917 674 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 PPIAL4FP0DN26 164 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 CD1DP15813 335 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 FDFT1P37268 417 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 ETV1P50549 477 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC7A2P52569 658 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 RPS15P62841 145 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF85Q03923 595 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 LIPNQ5VXI9 398 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 RAET1LQ5VY80 246 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 GDPD4Q6W3E5 623 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 COMMD1Q8N668 190 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 CEP112Q8N8E3 955 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 TRPV1Q8NER1 839 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 OR10A7Q8NGE5 316 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 RAPGEF5Q92565 580 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 PRAC1Q96KF2 57 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF778Q96MU6 729 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 GSDMAQ96QA5 445 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 MTMR9Q96QG7 549 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 PANX1Q96RD7 426 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM185BQ9H7F4 350 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 IL36GQ9NZH8 169 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 ICAM5Q9UMF0 924 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 PPIAL4AQ9Y536 164 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 TAPBPO15533 448 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 FGF17O60258 216 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 CA1P00915 261 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 JCHAINP01591 159 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 SP1P08047 785 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 HBQ1P09105 142 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 HOXB7P09629 217 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 ETS2P15036 469 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 FRMPD4Q14CM0 1322 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM189A2Q15884 450 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 C19orf48Q6RUI8 117 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM107Q6UX40 140 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 PDCL2Q8N4E4 241 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 DHRSXQ8N5I4 330 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 OR5L2Q8NGL0 311 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM81AQ8TBF8 368 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 BADQ92934 168 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 RCHY1Q96PM5 261 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC29A3Q9BZD2 475 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 IL1RAPQ9NPH3 570 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 ESM1Q9NQ30 184 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHL28Q9NXS3 571 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 CIDEBQ9UHD4 219 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF221Q9UK13 617 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 NINLQ9Y2I6 1382 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 GRIN2DO15399 1336 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A087WW49 117 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1B0GTQ1 180 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF212BA8MTL3 300 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 K7EQD1 137 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 CLDN9O95484 217 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 SELEP16581 610 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 CASP14P31944 242 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 UGT1A5P35504 534 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 NDST2P52849 883 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00205P59089 165 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 RPS6P62753 249 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 SPAG1Q07617 926 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 BST2Q10589 180 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 DOC2AQ14183 400 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC5A12Q1EHB4 618 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 FFAR4Q5NUL3 377 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 BEND3Q5T5X7 828 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 SPSB3Q6PJ21 355 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 UQCC3Q6UW78 93 aa5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms