RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469717.5

TPM3-215, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TPM3, Length 4,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-215ENST00000469717 ALPPL2P10696 532 aa7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 NSG1P42857 185 aa7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 CDH11P55287 796 aa7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 MAZP56270 477 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 TCEA2Q15560 299 aa7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 CDKN3Q16667 212 aa7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 ARL9Q6T311 187 aa7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 SIRT6Q8N6T7 355 aa7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 OR51G2Q8NGK0 314 aa7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 OR6T1Q8NGN1 323 aa7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 ING5Q8WYH8 240 aa7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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TPM3-215ENST00000469717 ARSGQ96EG1 525 aa7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 OR2M2Q96R28 347 aa7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 ZNF649Q9BS31 505 aa7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 CD93Q9NPY3 652 aa7.45□□□□□ -1.22
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TPM3-215ENST00000469717 GLAP06280 429 aa7.45□□□□□ -1.22
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TPM3-215ENST00000469717 AGTRAPQ6RW13 159 aa7.45□□□□□ -1.22
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TPM3-215ENST00000469717 YAF2Q8IY57 180 aa7.45□□□□□ -1.22
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TPM3-215ENST00000469717 C12orf57Q99622 126 aa7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
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TPM3-215ENST00000469717 SEC14L3Q9UDX4 400 aa7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.45□□□□□ -1.22
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TPM3-215ENST00000469717 FZD7O75084 574 aa7.45□□□□□ -1.22
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TPM3-215ENST00000469717 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.222e-6■■□□□ 14.5
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TPM3-215ENST00000469717 OR52B4Q8NGK2 314 aa7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 C16orf78Q8WTQ4 265 aa7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
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TPM3-215ENST00000469717 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
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TPM3-215ENST00000469717 CLEC4EQ9ULY5 219 aa7.45□□□□□ -1.22
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TPM3-215ENST00000469717 ASXL3Q9C0F0 2248 aa7.45□□□□□ -1.22
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TPM3-215ENST00000469717 GNSP15586 552 aa7.44□□□□□ -1.22
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TPM3-215ENST00000469717 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.44□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 SFXN4Q6P4A7 337 aa7.44□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 CRTC1Q6UUV9 634 aa7.44□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 C17orf47Q8NEP4 570 aa7.44□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 SVIPQ8NHG7 77 aa7.44□□□□□ -1.22
TPM3-215ENST00000469717 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa7.44□□□□□ -1.22
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