RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TRAM2Q15035 370 aa5.24□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 DCST2Q5T1A1 773 aa5.24□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 CDC42P60953 191 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 HPCAP84074 193 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 IL1RL1Q01638 556 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF91Q05481 1191 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ST3GAL3Q11203 375 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ST3GAL4Q11206 333 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.23□□□□□ -1.57
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