RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 VPS26AO75436 327 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 ACTL6AO96019 429 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 C1QAP02745 245 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 TFP02787 698 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 IFNW1P05000 195 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 MALP21145 153 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 NR2F2P24468 414 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 PSMB5P28074 263 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 GCKP35557 465 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 LIPAP38571 399 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 CD86P42081 329 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 TPI1P60174 286 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 SPOCK1Q08629 439 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM53BQ14153 422 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 FGFBP1Q14512 234 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 SPARCL1Q14515 664 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 C3orf36Q3SXR2 165 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF449Q6P9G9 518 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 OPN5Q6U736 354 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 Q6ZTK2 550 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 RRAGAQ7L523 313 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 LYG1Q8N1E2 194 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 NRACQ8N912 160 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 LINC01555Q8NAE3 123 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 DDHD1Q8NEL9 900 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 SDR9C7Q8NEX9 313 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 HSD17B8Q92506 261 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 MUL1Q969V5 352 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 RHBDF1Q96CC6 855 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 ISOC1Q96CN7 298 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 VMP1Q96GC9 406 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 MACROD1Q9BQ69 325 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 GPR35Q9HC97 309 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 MYO1AQ9UBC5 1043 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 OPN4Q9UHM6 478 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 MYO6Q9UM54 1294 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 PKD1P98161 4303 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 MYCBP2O75592 4640 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A1B0GW55 424 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 AHCYL1O43865 530 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 STX10O60499 249 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 RDH16O75452 317 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 GPC4O75487 556 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 MPZL1O95297 269 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 NSA2O95478 260 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 FTLP02792 175 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 NPSP0C0P6 89 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 DUX4L2P0CJ85 424 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 DUX4L3P0CJ86 424 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 DUX4L5P0CJ88 424 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 DUX4L6P0CJ89 424 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 DUX4L7P0CJ90 424 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 SAGP10523 405 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 ERCC2P18074 760 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 IL1RNP18510 177 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 IL32P24001 234 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 PKLRP30613 574 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 FOXN2P32314 431 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 GPR143P51810 404 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 RPL26P61254 145 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 RAB1AP62820 205 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 GALNT2Q10471 571 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 WASHC5Q12768 1159 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 DAG1Q14118 895 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 HEPACAMQ14CZ8 416 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 NDUFA9Q16795 377 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 PFKFB4Q16877 469 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 TIGD6Q17RP2 521 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 BCL7AQ4VC05 210 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF628Q5EBL2 1059 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 LCE1EQ5T753 118 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 MARC1Q5VT66 337 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF544Q6NX49 715 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM108Q6UXF1 575 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM151BQ6UXP7 276 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 GBP6Q6ZN66 633 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 CHMP1BQ7LBR1 199 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 MAVSQ7Z434 540 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 SLFN11Q7Z7L1 901 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 TXLNBQ8N3L3 684 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms