RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

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Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP-2.29□□□□□ -2.78
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SNORD54-201ENST00000459159 TTC30AQ86WT1 665 aa-2.29□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 SFR1Q86XK3 245 aa-2.29□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 CBWD2Q8IUF1 395 aa-2.29□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 C9orf40Q8IXQ3 194 aa-2.29□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 SCYL3Q8IZE3 742 aa-2.29□□□□□ -2.78
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SNORD54-201ENST00000459159 TMEM217Q8N7C4 229 aa-2.29□□□□□ -2.78
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SNORD54-201ENST00000459159 OR10S1Q8NGN2 331 aa-2.29□□□□□ -2.78
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SNORD54-201ENST00000459159 ACTL9Q8TC94 416 aa-2.29□□□□□ -2.78
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SNORD54-201ENST00000459159 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP-2.29□□□□□ -2.78
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SNORD54-201ENST00000459159 KBTBD4Q9NVX7 518 aa-2.29□□□□□ -2.78
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SNORD54-201ENST00000459159 FAM206AQ9NX38 181 aa-2.29□□□□□ -2.78
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SNORD54-201ENST00000459159 XCL2Q9UBD3 114 aa-2.29□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 SLC9A2Q9UBY0 812 aa-2.29□□□□□ -2.78
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SNORD54-201ENST00000459159 MYH10P35580 1976 aa-2.3□□□□□ -2.78
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SNORD54-201ENST00000459159 NUP188Q5SRE5 1749 aa-2.3□□□□□ -2.78
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SNORD54-201ENST00000459159 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 SPTLC2O15270 562 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 TTI1O43156 1089 aa-2.3□□□□□ -2.78
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SNORD54-201ENST00000459159 PLIN1O60240 522 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 ALOX12BO75342 701 aa-2.3□□□□□ -2.78
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SNORD54-201ENST00000459159 PDE9AO76083 593 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 IGHV3-9P01782 118 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 HLA-DQB1P01920 261 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 CHRNA1P02708 482 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 PF4P02776 101 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 TUBB4AP04350 444 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 CISD3P0C7P0 127 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 GLULP15104 373 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 GOT1P17174 413 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 CTSSP25774 331 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP-2.3□□□□□ -2.781e-20■■■■□ 23.8
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SNORD54-201ENST00000459159 MAP2K2P36507 400 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 MAP2K3P46734 347 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 GABRB2P47870 512 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 RAB13P51153 203 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 CCR3P51677 355 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 CCR6P51684 374 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 CCR8P51685 355 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 CLCN3P51790 818 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 EFNA4P52798 201 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 NDST1P52848 882 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 CASP6P55212 293 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 RAE1P78406 368 aaKnown RBP-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 HHEXQ03014 270 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 FOXM1Q08050 763 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 BNIP2Q12982 314 aa-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 IKQ13123 557 aaPredicted RBP-2.3□□□□□ -2.78
SNORD54-201ENST00000459159 PAK1Q13153 545 aa-2.3□□□□□ -2.78
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