RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 DAPK2Q9UIK4 370 aa23.5■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRODHO43272 600 aa23.49■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 CH25HO95992 272 aa23.49■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 NID1P14543 1247 aa23.49■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 KLHL22Q53GT1 634 aa23.49■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa23.49■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa23.49■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 OSTF1Q92882 214 aa23.49■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRRG3Q9BZD7 231 aa23.49■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 NLGN3Q9NZ94 848 aa23.49■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 A3GALT2U3KPV4 340 aa23.49■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 GXYLT2A0PJZ3 443 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 I3L1I5 382 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 KLF4O43474 513 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR10H2O60403 315 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC35E2P0CK97 266 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 BMP8BP34820 402 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 ETV5P41161 510 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAP3K8P41279 467 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 ETV1P50549 477 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 GAS6Q14393 721 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 ANKK1Q8NFD2 765 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR52R1Q8NGF1 315 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR4Q3Q8NH05 313 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 RNFT2Q96EX2 444 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 IL20Q9NYY1 176 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 SNTNA6NMZ2 147 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF217O75362 1048 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 APOL3O95236 402 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRIM16LQ309B1 348 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 VWA5B2Q8N398 1253 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 POGLUT1Q8NBL1 392 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 CA14Q9ULX7 337 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 CARD8Q9Y2G2 431 aa23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRIOO75962 3097 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 KRBA1A5PL33 1030 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 CBX7O95931 251 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 AK1P00568 194 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 WNT1P04628 370 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 HTR2AP28223 471 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 GAS1P54826 345 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 TDGQ13569 410 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPP1R14BQ96C90 147 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRSS27Q9BQR3 290 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 HCN3Q9P1Z3 774 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 IL20RAQ9UHF4 553 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRAPPC13A5PLN9 417 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDHR4A6H8M9 788 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDC42EP2O14613 210 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPP5CP53041 499 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 RAB40BQ12829 278 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF620Q6ZNG0 422 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARL14Q8N4G2 192 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM174AQ8TBP5 190 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAP3K3Q99759 626 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 CNPPD1Q9BV87 410 aa23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 KNL1Q8NG31 2342 aa23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 WWP2O00308 870 aa23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 BRINP1O60477 761 aa23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 MED26O95402 600 aa23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 CSF2P04141 144 aa23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 IFI6P09912 130 aa23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 MYL12AP19105 171 aa23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 SOX6P35712 828 aa23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 MTNR1AP48039 350 aa23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 RFX3P48380 749 aa23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC13A2Q13183 592 aa23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 ELOCQ15369 112 aa23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR1Q1Q15612 314 aa23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 MINDY4Q4G0A6 757 aa23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 RNF217Q8TC41 542 aa23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 TEX12Q9BXU0 123 aa23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 SURF4O15260 269 aa23.45■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 S100A5P33763 92 aa23.45■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRTGQ2VWP7 1150 aa23.45■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZAR1Q86SH2 424 aa23.45■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 LMX1AQ8TE12 382 aa23.45■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 MROQ9BYG7 248 aa23.45■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 NDUFB11Q9NX14 153 aa23.45■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 DOLKQ9UPQ8 538 aa23.45■■□□□ 1.35
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