RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM73Q86UV7 250 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 DNAJC22Q8N4W6 341 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 DNAJC9Q8WXX5 260 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 MCUR1Q96AQ8 359 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC126Q96EE4 140 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 CFAP36Q96G28 342 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 FAR2Q96K12 515 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 NMUR2Q9GZQ4 415 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 TRPC4Q9UBN4 977 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 MAGEA13PA6NCF6 341 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 MGAT4DA6NG13 374 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 H3BNX3 289 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 GOLGA8RI6L899 631 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 TCF21O43680 179 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 CIB2O75838 187 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 ANXA9O76027 345 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 NEURL1O76050 574 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 GABRA1P14867 456 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 UGT2B7P16662 529 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 ERCC2P18074 760 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 HNF1AP20823 631 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 ID2Q02363 134 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 PCLAFQ15004 111 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 H3F3CQ6NXT2 135 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 OR52E1Q8NGJ3 308 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 STMN2Q93045 179 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 IMMP1LQ96LU5 166 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 LYSMD1Q96S90 227 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 SORT1Q99523 831 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 GPR22Q99680 433 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 MGME1Q9BQP7 344 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 GPR63Q9BZJ6 419 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRK-211ENST00000429595 VGLL3A8MV65 326 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD66B4E2M5 251 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRK-211ENST00000429595 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRK-211ENST00000429595 G3V2L1 256 aa5.64□□□□□ -1.51
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PTPRK-211ENST00000429595 HDAC3O15379 428 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRK-211ENST00000429595 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRK-211ENST00000429595 MFSD11O43934 449 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRK-211ENST00000429595 ENTPD5O75356 428 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRK-211ENST00000429595 EPOP01588 193 aa5.64□□□□□ -1.51
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