RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 ANGPTL1O95841 491 aa18.9■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 FCGR2AP12318 317 aa18.9■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF17P17021 662 aa18.9■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 SDC1P18827 310 aa18.9■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 CD79BP40259 229 aa18.9■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 PCLAFQ15004 111 aa18.9■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 KANK2Q63ZY3 851 aa18.9■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 APOOLQ6UXV4 268 aa18.9■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa18.9■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 OR2T11Q8NH01 316 aa18.9■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 MTERF3Q96E29 417 aa18.9■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 POM121Q96HA1 1249 aa18.9■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 MS4A4EQ96PG1 132 aa18.9■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 PINK1Q9BXM7 581 aa18.9■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa18.9■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 GXYLT2A0PJZ3 443 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 H0YC42 278 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 H3BML4 177 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 LSM1O15116 133 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 CTIFO43310 598 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 CHEK2O96017 543 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 CGAP01215 116 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV1D-16P01601 117 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 CD53P19397 219 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 LCN1P31025 176 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 HOXC12P31275 282 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 GPC1P35052 558 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 CLDN20P56880 219 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 FAM27E3Q08E93 113 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 GRAMD1BQ3KR37 738 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF385BQ569K4 471 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 BTLAQ7Z6A9 289 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 C10orf107Q8IVU9 208 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 FAM110BQ8TC76 370 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 PIK3R3Q92569 461 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 PPCDCQ96CD2 204 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 GIMAP5Q96F15 307 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 PGM2Q96G03 612 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 TUBB1Q9H4B7 451 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 STOML1Q9UBI4 398 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 ABCA4P78363 2273 aa18.89■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 A0A087WZY1 265 aa18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 C7orf72A4D263 438 aa18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 SEC14L5O43304 696 aa18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM13O60858 407 aa18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 FGF4P08620 206 aa18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 ASMTP46597 345 aa18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 RFX3P48380 749 aa18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 MLC1Q15049 377 aa18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 PON3Q15166 354 aa18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 POU4F3Q15319 338 aa18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 GGNQ86UU5 652 aa18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 NUP43Q8NFH3 380 aa18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 OR5M1Q8NGP8 315 aa18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 OR6Y1Q8NGX8 325 aa18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 FNDC9Q8TBE3 224 aa18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 GPR151Q8TDV0 419 aa18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 SLC39A3Q9BRY0 314 aa18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 NEUROD4Q9HD90 331 aa18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 EQTNQ9NQ60 294 aa18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF226Q9NYT6 803 aa18.88■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM23A6NLE4 172 aa18.87■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 DIAPH2O60879 1101 aa18.87■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 DDX5P17844 614 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 TBXA2RP21731 343 aa18.87■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 CRYGSP22914 178 aa18.87■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 CCKARP32238 428 aa18.87■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 UGT2B10P36537 528 aa18.87■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 MANFP55145 182 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 RPL38P63173 70 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa18.87■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 FAM214BQ7L5A3 538 aa18.87■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 MISPQ8IVT2 679 aa18.87■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 C4orf33Q8N1A6 199 aa18.87■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 LRRN4CLQ8ND94 238 aa18.87■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa18.87■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 TSSK3Q96PN8 268 aa18.87■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 PCNX3Q9H6A9 2034 aa18.86■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 DEFB108AA8MXU0 73 aa18.86■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFB5O43674 189 aa18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms