RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KNL1Q8NG31 2342 aa17.41■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PEX12O00623 359 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRG2P13727 222 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BMP8BP34820 402 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GAS1P54826 345 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAZP56270 477 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM16LQ309B1 348 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GALNT12Q8IXK2 581 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OSTF1Q92882 214 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRRG3Q9BZD7 231 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IRAK4Q9NWZ3 460 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DAPK2Q9UIK4 370 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM131Q92545 1883 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRBA1A5PL33 1030 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPIPA7E9PJI5 369 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHST10O43529 356 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC35E2P0CK97 266 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPIPA8P0DM63 369 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD97P48960 835 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1DQ13901 141 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLHL22Q53GT1 634 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC30A6Q6NXT4 461 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FIGNL1Q6PIW4 674 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM174AQ8TBP5 190 aa17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDHR4A6H8M9 788 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNTNA6NMZ2 147 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CBX7O95931 251 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AK1P00568 194 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HTR2AP28223 471 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GABRA3P34903 492 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ETV5P41161 510 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ETV1P50549 477 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB40BQ12829 278 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GAS6Q14393 721 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MINDY4Q4G0A6 757 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PERM1Q5SV97 790 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF620Q6ZNG0 422 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VWA5B2Q8N398 1253 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MINDY2Q8NBR6 621 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKK1Q8NFD2 765 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR4Q3Q8NH05 313 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRSS27Q9BQR3 290 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDUFB11Q9NX14 153 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NLGN3Q9NZ94 848 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CFL2Q9Y281 166 aa17.39■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GXYLT2A0PJZ3 443 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAPPC13A5PLN9 417 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF217O75362 1048 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GKN3PP0CG01 181 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTNP21246 168 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP5CP53041 499 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRTGQ2VWP7 1150 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C3orf38Q5JPI3 329 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF687Q8N1G0 1237 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNFT2Q96EX2 444 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBCK1Q9BYM8 510 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LMAN1LQ9HAT1 526 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DOLKQ9UPQ8 538 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 I3L1I5 382 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDC42EP2O14613 210 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR10H2O60403 315 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BRINP1O60477 761 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WNT1P04628 370 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD40LGP29965 261 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTNR1AP48039 350 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR52R1Q8NGF1 315 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEC14L4Q9UDX3 406 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CARD8Q9Y2G2 431 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDH10Q9Y6N8 788 aa17.38■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IRGMA1A4Y4 181 aa17.37■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SURF4O15260 269 aa17.37■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NKX2-2O95096 273 aa17.37■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APOL3O95236 402 aa17.37■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MED26O95402 600 aa17.37■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CH25HO95992 272 aa17.37■□□□□ 0.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CSF2P04141 144 aa17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms