RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417936.5

SH3BP5-205, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 826 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-205ENST00000417936 LINC01560Q8TB33 94 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 TMBIM1Q969X1 311 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 ELP4Q96EB1 424 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 SLC35A4Q96G79 324 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 VSTM2LQ96N03 204 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 SFXN2Q96NB2 322 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 BTBD9Q96Q07 612 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 CCT7Q99832 543 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 NUF2Q9BZD4 464 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 RTN4RQ9BZR6 473 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 MIEF1Q9NQG6 463 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 DLL4Q9NR61 685 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 GALNT8Q9NY28 637 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 DKKL1Q9UK85 242 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 PACSIN3Q9UKS6 424 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 RAP2CQ9Y3L5 183 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 FAM171A2A8MVW0 826 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 C9JVG2 144 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 SDHDO14521 159 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 PDPK1O15530 556 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 PLOD3O60568 738 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 TSPAN2O60636 221 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 COQ9O75208 318 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 SNNO75324 88 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 SLITRK5O94991 958 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 IGKV1D-16P01601 117 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 HRGP04196 525 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 G6PDP11413 515 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 SERPINB5P36952 375 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 FRKP42685 505 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 PCYT1AP49585 367 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 LHX2P50458 406 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 RPL14P50914 215 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 PHC1P78364 1004 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 PSG6Q00889 435 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 BCL2A1Q16548 175 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 AGBL2Q5U5Z8 902 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 SHEQ5VZ18 495 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 MAVSQ7Z434 540 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 P4HA3Q7Z4N8 544 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 GALNT10Q86SR1 603 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 FNDC5Q8NAU1 212 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 OR4K17Q8NGC6 315 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 FBXO30Q8TB52 745 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 PPCDCQ96CD2 204 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 GIMAP5Q96F15 307 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 PPP3R2Q96LZ3 170 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 ADOQ96SZ5 270 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 EQTNQ9NQ60 294 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 FBXO34Q9NWN3 711 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 TAS2R9Q9NYW1 312 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 CLCF1Q9UBD9 225 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 ATP6V1HQ9UI12 483 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 HAO1Q9UJM8 370 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 MED12LQ86YW9 2145 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 ITPR3Q14573 2671 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 GOLGA8OA6NCC3 632 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 A8MXE2 369 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 GOLGA8NF8WBI6 632 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 LINC01387J3KSC0 135 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 PLOD2O00469 737 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 MSTNO14793 375 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 ARHGEF9O43307 516 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 TBX19O60806 448 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 PSMG1O95456 288 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 ACP2P11117 423 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 ZNF708P17019 499 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 GRK2P25098 689 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 DPP4P27487 766 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 NTSP30990 170 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 PNLIPRP2P54317 469 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 PRKAG1P54619 331 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 FOXF2Q12947 444 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 FGFBP1Q14512 234 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 GANABQ14697 944 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 IKBIPQ70UQ0 350 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP5-205ENST00000417936 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms