RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 DSG2Q14126 1118 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 LTB4RQ15722 352 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 KLBQ86Z14 1044 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL36Q8N4N3 616 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 HDDC3Q8N4P3 179 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 YIPF7Q8N8F6 280 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM145Q8NBT3 493 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 TRPV4Q9HBA0 871 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 ALG5Q9Y673 324 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 SCN3AQ9NY46 2000 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM183AA6NL82 134 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 SYT5O00445 386 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 EMC8O43402 210 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 APODP05090 189 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 CPN2P22792 545 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 EVX1P49640 407 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 TFF2Q03403 129 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 CHRDL2Q6WN34 429 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 TTLQ8NG68 377 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM255BQ8WV15 326 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 ART5Q96L15 291 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 SOSTQ9BQB4 213 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 SYNPO2LQ9H987 977 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 RMI1Q9H9A7 625 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC6A20Q9NP91 592 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 GIMAP4Q9NUV9 329 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 K7EQS6 105 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 SOCS6O14544 535 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 ZIC1Q15915 447 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM214AQ32MH5 1076 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXL6Q8N531 539 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 OSTF1Q92882 214 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 ACSL5Q9ULC5 683 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 LYRM1O43325 122 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 THY1P04216 161 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 PRKAR1AP10644 381 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 ALAS2P22557 587 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 HLA-DMAP28067 261 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 IFNA8P32881 189 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 PDX1P52945 283 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 CTBP2P56545 445 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 CST6Q15828 149 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 MZT2BQ6NZ67 158 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC48A1Q6P1K1 146 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 ELP4Q96EB1 424 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 MCHR1Q99705 422 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 BTBD1Q9H0C5 482 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 SLA2Q9H6Q3 261 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 MOSPD1Q9UJG1 213 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 CES1P1Q9UKY3 287 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 EGFP01133 1207 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 F3P13726 295 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 MPIP34949 423 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 INPP1P49441 399 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 YIF1BQ5BJH7 314 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 TDHQ8IZJ6 230 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 OR51G2Q8NGK0 314 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 NACC2Q96BF6 587 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 NECTIN4Q96NY8 510 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF649Q9BS31 505 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF32Q9H0A6 362 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 CA5BQ9Y2D0 317 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM25AB3EWG3 89 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM25CB3EWG5 89 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM25GB3EWG6 89 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 HLA-DQB1P01920 261 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 COL9A1P20849 921 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 EFR3AQ14156 821 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 PGGHGQ32M88 737 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 AGBL4Q5VU57 503 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 VASNQ6EMK4 673 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 CPOQ8IVL8 374 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 SIRT6Q8N6T7 355 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2L5Q8NG80 312 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 UPRTQ96BW1 309 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 FCRL4Q96PJ5 515 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 TEX12Q9BXU0 123 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 HDAC8Q9BY41 377 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR26Q9H7D7 661 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL28Q9NXS3 571 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 IL20Q9NYY1 176 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 CBLCQ9ULV8 474 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 CHST10O43529 356 aa17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms