RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 ANKRD12Q6UB98 2062 aa6.16□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1W2PRQ8 180 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 OR2W5A6NFC9 320 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 EFCAB7A8K855 629 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 A8MUA0 341 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 H3BNH8 94 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 M0R3H8 397 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 FFAR1O14842 300 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 PCDH17O14917 1159 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SLC16A6O15403 523 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 KIAA0513O60268 411 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 BRINP1O60477 761 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 KCNK2O95069 426 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 RECKO95980 971 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 HEXBP07686 556 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 GNAO1P09471 354 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 FGF5P12034 268 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 AGXTP21549 392 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 RORAP35398 523 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 IFNGR2P38484 337 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MAP3K8P41279 467 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 LIMS1P48059 325 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TAS2R41P59536 307 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 DCAF7P61962 342 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 DCDP81605 110 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MYBPC1Q00872 1141 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 RHAGQ02094 409 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 NPRL3Q12980 569 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 DGCR6Q14129 220 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 KEAP1Q14145 624 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 IL11RAQ14626 422 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 NSDHLQ15738 373 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 DECR1Q16698 335 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CCNJQ5T5M9 372 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TCEAL6Q6IPX3 200 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 OFCC1Q8IZS5 231 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF615Q8N8J6 731 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 OR6T1Q8NGN1 323 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TSLPQ969D9 159 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TCEAL3Q969E4 200 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SLC38A4Q969I6 547 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 PRRC1Q96M27 445 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MUS81Q96NY9 551 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 RHCGQ9UBD6 479 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ACAD8Q9UKU7 415 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ERVK-19Q9WJR5 959 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 R4GN57 208 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.15□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 LRP4O75096 1905 aa6.15□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa6.14□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 A0A087WXM4 84 aa6.14□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.14□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.14□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 OR6C76A6NM76 312 aa6.14□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa6.14□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 HRKO00198 91 aa6.14□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
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