RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa18.76■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 FITM1A5D6W6 292 aa18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF749O43361 778 aa18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 S1PR1P21453 382 aa18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 NXPH1P58417 271 aa18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 UBXN2BQ14CS0 331 aa18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 MED22Q15528 200 aa18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 MAPK14Q16539 360 aa18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 DEFB110Q30KQ9 67 aa18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 C3orf38Q5JPI3 329 aa18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 C16orf87Q6PH81 154 aa18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 CHRDL2Q6WN34 429 aa18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF620Q6ZNG0 422 aa18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 Q6ZNX1 250 aa18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 MED25Q71SY5 747 aa18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 ATCAYQ86WG3 371 aa18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 NANOGP1Q8N7R0 232 aa18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 OR5M11Q96RB7 305 aa18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 MAP3K3Q99759 626 aa18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 CDH10Q9Y6N8 788 aa18.75■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 A0A1W2PPC1 479 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 H0YIG0 161 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 CLDN4O14493 209 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 AQP9O43315 295 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 HRO43593 1189 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 RAB36O95755 333 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 ADRA2AP08913 450 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 C1DQ13901 141 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 MINDY4Q4G0A6 757 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 CCNJQ5T5M9 372 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 OR52R1Q8NGF1 315 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 C1orf216Q8TAB5 229 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 PIK3R3Q92569 461 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 EGLN3Q9H6Z9 239 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 SIAEQ9HAT2 523 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 TBCCD1Q9NVR7 557 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 GABRA3P34903 492 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 SPHARQ15513 63 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF613Q6PF04 617 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 NRMQ8IXM6 262 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 SPEM1Q8N4L4 309 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 OR8D4Q8NGM9 314 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 OIT3Q8WWZ8 545 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 OPALINQ96PE5 141 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 PRSS27Q9BQR3 290 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 PRR14Q9BWN1 585 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 KCNE5Q9UJ90 142 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 SLC7A7Q9UM01 511 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM5Q9Y2B1 443 aa18.74■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 I3L1I5 382 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 KCNK2O95069 426 aa18.73■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 HMGN1P05114 100 aa18.73■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 DRD5P21918 477 aa18.73■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 HSD17B7P56937 341 aa18.73■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF404Q494X3 552 aa18.73■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 C14orf28Q4W4Y0 310 aa18.73■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 C7orf57Q8NEG2 295 aa18.73■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 RFKQ969G6 155 aa18.73■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF559Q9BR84 538 aa18.73■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 ISYNA1Q9NPH2 558 aa18.73■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 CNIH4Q9P003 139 aa18.73■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 CORINQ9Y5Q5 1042 aa18.73■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 METTL15A6NJ78 407 aa18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 ARHGAP33O14559 1287 aa18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 IDUAP35475 653 aa18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 PSG6Q00889 435 aa18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 STX4Q12846 297 aa18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 TUBA3EQ6PEY2 450 aa18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 MFSD4AQ8N468 514 aa18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 OR52I1Q8NGK6 324 aa18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM255BQ8WV15 326 aa18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 RIT1Q92963 219 aa18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 HLA-CQ95604 372 aa18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 PPP1R14BQ96C90 147 aa18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 HSPBAP1Q96EW2 488 aa18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 ZDHHC12Q96GR4 267 aa18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 SPACA7Q96KW9 195 aa18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 VSTM2LQ96N03 204 aa18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 FOLH1BQ9HBA9 442 aa18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 PDE7BQ9NP56 450 aa18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 TAS2R16Q9NYV7 291 aa18.72■□□□□ 0.59
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms