RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411083.1

RNU6-1135P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1135, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1135P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1135P-201ENST00000411083 UCN3Q969E3 161 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RASL10BQ96S79 203 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PNPLA3Q9NST1 481 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MAGEB16A2A368 324 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NPIPA5E9PKD4 350 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 EI24O14681 340 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SH2D1BO14796 132 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SDC3O75056 442 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CABYRO75952 493 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CRISP2P16562 243 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NNMTP40261 264 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NPBWR1P48145 328 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C17orf67Q0P5P2 114 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 HSPA14Q0VDF9 509 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ARFRP1Q13795 201 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CST9LP1Q5W188 147 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DNM1P46Q6ZS02 220 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RFLNAQ6ZTI6 216 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LCA5Q86VQ0 697 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SKA3Q8IX90 412 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PEX5LQ8IYB4 626 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 Q8N976 141 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ATG101Q9BSB4 218 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GPR173Q9NS66 373 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GNPTGQ9UJJ9 305 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SYNJ2O15056 1496 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SULT2B1O00204 365 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CTDSPLO15194 276 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TXNDC12O95881 172 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ADSSP30520 456 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZNF273Q14593 569 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SMARCD3Q6STE5 483 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZNF621Q6ZSS3 439 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MAATS1Q7Z4T9 603 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PARGQ86W56 976 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 APOOQ9BUR5 198 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RNF126Q9BV68 326 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IDI2Q9BXS1 227 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LHX5Q9H2C1 402 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 VPS18Q9P253 973 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SWAP70Q9UH65 585 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RAB23Q9ULC3 237 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 WDR45Q9Y484 360 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SNX8Q9Y5X2 465 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CACNA1GO43497 2377 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C5orf52A6NGY3 159 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PDLIM1O00151 329 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 WDR46O15213 610 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 REC8O95072 547 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CDRT1O95170 752 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ECDO95905 644 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IGKV1-16P04430 117 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ADRA2AP08913 450 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PPIAL4GP0DN37 164 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CYP3A5P20815 502 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 COX7A1P24310 79 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GCKP35557 465 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IER3P46695 156 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RPL29P47914 159 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IL15RAQ13261 267 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TRADDQ15628 312 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CYP51A1Q16850 503 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FBXW9Q5XUX1 488 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C1orf94Q6P1W5 598 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PCP2Q8IVA1 136 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PNKDQ8N490 385 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FAM86B1Q8N7N1 296 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 POMGNT2Q8NAT1 580 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms