RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 SPPL2AQ8TCT8 520 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 TP53INP1Q96A56 240 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 RILPQ96NA2 401 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 FRG2BQ96QU4 278 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 SERPINI1Q99574 410 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 SH3GL2Q99962 352 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 NTMT1Q9BV86 223 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 FUT8Q9BYC5 575 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 EXO5Q9H790 373 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 WDR41Q9HAD4 459 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 XPR1Q9UBH6 696 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 B4GALT7Q9UBV7 327 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 PCTPQ9UKL6 214 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 DTX4Q9Y2E6 619 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 HCFC1P51610 2035 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 A0A1B0GTL3 188 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 STX16O14662 325 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 SNX4O95219 450 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 ZWINTO95229 277 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 EPPINO95925 133 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 HPNP05981 417 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 RPS17P08708 135 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 NR2F1P10589 423 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 CD1EP15812 388 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 S1PR1P21453 382 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 GPX3P22352 226 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 FPR2P25090 351 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 GDF1P27539 372 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 GCH1P30793 250 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 PGM1P36871 562 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 CASP3P42574 277 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 KCNJ5P48544 419 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 TMED10P49755 219 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 CDK9P50750 372 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 ART1P52961 327 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 IST1P53990 364 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 WNT3P56703 355 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 DOC2BQ14184 412 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 ARSKQ6UWY0 536 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 SYT10Q6XYQ8 523 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 IKBIPQ70UQ0 350 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 LIX1Q8N485 282 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 SLC44A1Q8WWI5 657 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 C3orf49Q96BT1 292 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 PHF21BQ96EK2 531 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 TIMP4Q99727 224 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 ANGPTL4Q9BY76 406 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 OR10A5Q9H207 317 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 ALKBH4Q9NXW9 302 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 CES1P1Q9UKY3 287 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 C15orf41Q9Y2V0 281 aa6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 HSPB2A8KAH6 182 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 CAPN14A8MX76 684 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 AHRRA9YTQ3 701 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 TP53I11O14683 189 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 PGM3O95394 542 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 ATP1B1P05026 303 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 KLK1P06870 262 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 QDPRP09417 244 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 SBK3P0C264 359 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 CPMP14384 443 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 PIK3R1P27986 724 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 PHBP35232 272 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 TIMP3P35625 211 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 XKP51811 444 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 CCNG1P51959 295 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF136P52737 540 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 DUSP2Q05923 314 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 MGAT2Q10469 447 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 HSPB2Q16082 182 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 NHSL2Q5HYW2 709 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 DCST1Q5T197 706 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 TMEM198Q66K66 360 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 VASNQ6EMK4 673 aa6.35□□□□□ -1.39
CTXN3-201ENST00000379445 C8orf74Q6P047 294 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms