RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 HLA-DQB1P01920 261 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 DRD3P35462 400 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 UBE3AQ05086 875 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 IRF4Q15306 451 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF628Q5EBL2 1059 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 CNIH2Q6PI25 160 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 SLC36A4Q6YBV0 504 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF730Q6ZMV8 503 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 C16orf62Q7Z3J2 963 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 VRK2Q86Y07 508 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 CLDN22Q8N7P3 220 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM163Q8TC26 289 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 MS4A6EQ96DS6 147 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 TEX101Q9BY14 249 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 ASB4Q9Y574 426 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 COL4A3Q01955 1670 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 BET1O15155 118 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 SLC43A1O75387 559 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 NTN1O95631 604 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 AIFM1O95831 613 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 ACP2P11117 423 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 CERS1P27544 350 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 IFNGR2P38484 337 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 RPS25P62851 125 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 PDGFRLQ15198 375 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 C3orf38Q5JPI3 329 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 SLC25A30Q5SVS4 291 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 KIAA1211LQ6NV74 962 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM64Q6YI46 380 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 HDDC3Q8N4P3 179 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 OR56A1Q8NGH5 318 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 SMARCD2Q92925 531 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 ZG16BQ96DA0 208 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 KCTD7Q96MP8 289 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 ASB16Q96NS5 453 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 SLC38A2Q96QD8 506 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 OR7D2Q96RA2 312 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 PRDM7Q9NQW5 492 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 C5orf42Q9H799 3197 aa12.33□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 PCP4L1A6NKN8 68 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ISM1B1AKI9 464 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 CASC3O15234 703 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 PRODHO43272 600 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 CH25HO95992 272 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 RAF1P04049 648 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 AVPR1BP47901 424 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 MTNR1AP48039 350 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 PRR5P85299 388 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 TGM3Q08188 693 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 RAB40BQ12829 278 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ANGPT1Q15389 498 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 FCN2Q15485 313 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ZIC1Q15915 447 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ABHD17CQ6PCB6 329 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 HSDL2Q6YN16 418 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ZFP41Q8N8Y5 198 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 NUP43Q8NFH3 380 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 OR52E1Q8NGJ3 308 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SFXN5Q8TD22 340 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 DPP7Q9UHL4 492 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 A0A1W2PP55 124 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SLC30A4O14863 429 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 EMC8O43402 210 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 HPGDSO60760 199 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 MPIP34949 423 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 MC3RP41968 323 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 EFNB1P98172 346 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 TRAM2Q15035 370 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 PLK5Q496M5 336 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 AGBL4Q5VU57 503 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 PRSS42Q7Z5A4 293 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 LHFPL3Q86UP9 236 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ZBTB44Q8NCP5 570 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 OR9A2Q8NGT5 310 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 OR2L8Q8NGY9 312 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 OR52P1PQ8NH57 321 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 GANCQ8TET4 914 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 TM9SF4Q92544 642 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 KAT2AQ92830 837 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 UFD1Q92890 307 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 KATNB1Q9BVA0 655 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SLC6A20Q9NP91 592 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ZFP64Q9NPA5 681 aa12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms