RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 UNC5DQ6UXZ4 953 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 RTL4Q6ZR62 310 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 RNF44Q7L0R7 432 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 HMGN2P46Q86SG4 172 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC9A6Q92581 669 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 VPS29Q9UBQ0 182 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 SERGEFQ9UGK8 458 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF860A6NHJ4 632 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 BET1O15155 118 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 SSNA1O43805 119 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 PPM1BO75688 479 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 RAB36O95755 333 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 EVX1P49640 407 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 PRLHRP49683 370 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 ADPRHP54922 357 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 HSPB3Q12988 150 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 INSL4Q14641 139 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 GPR68Q15743 365 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM52BQ4KMG9 183 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 DEF8Q6ZN54 512 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM92BQ6ZTR7 304 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 OR8J2Q8NGG1 315 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 NEIL3Q8TAT5 605 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM163Q8TC26 289 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 LRR1Q96L50 414 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 LINC00052Q96N35 136 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC12A9Q9BXP2 914 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 MAB21L2Q9Y586 359 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 ENPP4Q9Y6X5 453 aa10.5□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A1W2PPL8 197 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 SGTAO43765 313 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 RRASP10301 218 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 OSMP13725 252 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 MAOBP27338 520 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 XCR1P46094 333 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 CXCL12P48061 93 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 PLK5Q496M5 336 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 CLLU1Q5K131 121 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 IDNKQ5T6J7 187 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 MZT2AQ6P582 158 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 IL20RBQ6UXL0 311 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF765Q7L2R6 523 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 OR4E2Q8NGC2 313 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 OR52I1Q8NGK6 324 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 OR8J1Q8NGP2 316 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 ADAM30Q9UKF2 790 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 ROS1P08922 2347 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 M0R233 179 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 SDC3O75056 442 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 MPC2O95563 127 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 THEGLP0DJG4 465 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 CPEP16870 476 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 NOS3P29474 1203 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 MANFP55145 182 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 WNT4P56705 351 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 NTRK2Q16620 822 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 Q6ZSR6 202 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 LHFPL3Q86UP9 236 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 MARC2Q969Z3 335 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 NLNQ9BYT8 704 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 ENAMQ9NRM1 1142 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 HCN3Q9P1Z3 774 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 CLEC4AQ9UMR7 237 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 CD8B2A6NJW9 211 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 LANCL1O43813 399 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 C6orf47O95873 294 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 HLA-DQB1P01920 261 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 PROS1P07225 676 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 NR2F1P10589 423 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 CD8BP10966 210 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 SRP9P49458 86 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 CEACAM20Q6UY09 585 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 GPR155Q7Z3F1 870 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 VRK3Q8IV63 474 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa10.49□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 GSDMCQ9BYG8 508 aa10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms