RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 NEIL3Q8TAT5 605 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 MAL2Q969L2 176 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PPCDCQ96CD2 204 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SLC22A12Q96S37 553 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 LYSMD1Q96S90 227 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 P2RY13Q9BPV8 354 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF700Q9H0M5 742 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CERS4Q9HA82 394 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 IL26Q9NPH9 171 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 MED17Q9NVC6 651 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ATPIF1Q9UII2 106 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CACNG2Q9Y698 323 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 DVL2O14641 736 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PLOD3O60568 738 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 HPGDSO60760 199 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TYRP14679 529 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 UQCRC2P22695 453 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CCR2P41597 374 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 MTNR1AP48039 350 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TAP2Q03519 686 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CNTN1Q12860 1018 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 GAB1Q13480 694 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CDH18Q13634 790 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 GNA13Q14344 377 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PLA1AQ53H76 456 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SYT14P1Q58G82 188 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CDC73Q6P1J9 531 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 RTL4Q6ZR62 310 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TRILQ7L0X0 811 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TPRA1Q86W33 373 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TCEANCQ8N8B7 351 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 HUS1BQ8NHY5 278 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TM9SF4Q92544 642 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2E3Q969T4 207 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PDXPQ96GD0 296 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC120Q96HB5 630 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ATF6BQ99941 703 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ABCG5Q9H222 651 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 OR51J1Q9H342 316 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 GHITMQ9H3K2 345 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SGK2Q9HBY8 427 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 A4GALTQ9NPC4 353 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 MYNNQ9NPC7 610 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CD93Q9NPY3 652 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF222Q9UK12 451 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0A6YYJ9 748 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PRQ8 180 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 M0R233 179 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TBL1XO60907 577 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 NME6O75414 186 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 MOSPD3O75425 235 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PAHP00439 452 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 OPN1SWP03999 348 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 FHP07954 510 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SRCP12931 536 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 GJA1P17302 382 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SERPINA4P29622 427 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 BCL6P41182 706 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PITPNBP48739 271 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 MVDP53602 400 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 RPS24P62847 133 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 HBA1P69905 142 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CTAG1AP78358 180 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PDE7AQ13946 482 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 HBMQ6B0K9 141 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SLC27A4Q6P1M0 643 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 MED27Q6P2C8 311 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM65Q6PI78 240 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 RRM2BQ7LG56 351 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms