RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 KLHL4Q9C0H6 718 aa9.31□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 RNF122Q9H9V4 155 aa9.31□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 Q9N2J8 555 aa9.31□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 MID1IP1Q9NPA3 183 aa9.31□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 ELOVL5Q9NYP7 299 aa9.31□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 PROCRQ9UNN8 238 aa9.31□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 ABCG2Q9UNQ0 655 aa9.31□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 A0A087WV62 115 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 UPK1AO00322 258 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 EMC8O43402 210 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 IL33O95760 270 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 CGAP01215 116 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 CD8BP10966 210 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 PCSK6P29122 969 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 PRKAA2P54646 552 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 FOXA1P55317 472 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 GALNT18Q6P9A2 607 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 TIFABQ6ZNK6 161 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 CCNYL1Q8N7R7 359 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 ARSGQ96EG1 525 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 L3HYPDHQ96EM0 354 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 COX4I2Q96KJ9 171 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 PRRG4Q9BZD6 226 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 GLIPR2Q9H4G4 154 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 GSTO2Q9H4Y5 243 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 GRID1Q9ULK0 1009 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 CLEC4AQ9UMR7 237 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF175Q9Y473 711 aa9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 GXYLT2A0PJZ3 443 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 SERTM1A2A2V5 107 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 TRIM64A6NGJ6 449 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 TRIM64BA6NI03 449 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 LINC01387J3KSC0 135 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 CRCPO75575 148 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 AQP8O94778 261 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 SLITRK5O94991 958 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 UTS2O95399 124 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 ANGPTL1O95841 491 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 PLGP00747 810 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 TBXA2RP21731 343 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 GABRA3P34903 492 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 PCYT1AP49585 367 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 C17orf67Q0P5P2 114 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 HSPB3Q12988 150 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 FGFBP1Q14512 234 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 GRAMD1BQ3KR37 738 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 FAM71E1Q6IPT2 247 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 C22orf34Q6ZV56 151 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 FAM214BQ7L5A3 538 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 LCA5Q86VQ0 697 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 OR2L13Q8N349 312 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 METTL25Q8N6Q8 603 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 PIK3R3Q92569 461 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 SLC9A6Q92581 669 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 ELP4Q96EB1 424 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 AMDHD1Q96NU7 426 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 BDH2Q9BUT1 245 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 C3orf14Q9HBI5 128 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 MYNNQ9NPC7 610 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 EQTNQ9NQ60 294 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 SIRT5Q9NXA8 310 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 VDAC3Q9Y277 283 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 EMC9Q9Y3B6 208 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 AP4B1Q9Y6B7 739 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 ITPR3Q14573 2671 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 ZFHX3Q15911 3703 aa9.29□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 PCNX3Q9H6A9 2034 aa9.28□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 KCNH1O95259 989 aa9.28□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 PSMG1O95456 288 aa9.28□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 IGKV1D-16P01601 117 aa9.28□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 OPN1LWP04000 364 aa9.28□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 ABHD2P08910 425 aa9.28□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 FCGR2AP12318 317 aa9.28□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 LOXP28300 417 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 SLC6A8P48029 635 aa9.28□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 PRKAG1P54619 331 aa9.28□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 CTBP2P56545 445 aa9.28□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 GUSBP1Q15486 140 aa9.28□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CLRN3-201ENST00000368671 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.9 ms