RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIR2DL4Q99706 377 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 FEM1AQ9BSK4 669 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSSK1BQ9BXA7 367 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCSER1Q9C0I3 900 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 COMMD4Q9H0A8 199 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLITRK2Q9H156 845 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPH5Q9H2P9 285 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLE3Q9NRF9 147 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 VNN3Q9NY84 501 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAS2R3Q9NYW6 316 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 B4GALT7Q9UBV7 327 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q9UF83 564 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLEC4EQ9ULY5 219 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 DUSP12Q9UNI6 340 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF6Q9Y252 685 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP6P35125 1406 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 NCAPD2Q15021 1401 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP8B3O60423 1300 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 RGSL1A5PLK6 1076 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 SAGE2PA6NJ88 616 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 E9PLD3 99 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 HAT1O14929 419 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLDN3O15551 220 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 NOL4O94818 638 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 LY6G6DO95868 133 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 AK1P00568 194 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 CALCBP10092 127 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP2F1P24903 491 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIF5BP33176 963 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD86P42081 329 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 NOVP48745 357 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 P2RY4P51582 365 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPL8P62917 257 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM41BQ5BJD5 291 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 FHL5Q5TD97 284 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 METTL11BQ5VVY1 283 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR8G2PQ6IF36 304 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 NIPAL3Q6P499 406 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 AFTPHQ6ULP2 937 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 CENPUQ71F23 418 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM17Q86X19 198 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR137CQ8N3F9 429 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 C11orf42Q8N5U0 333 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSNK1A1LQ8N752 337 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSMG2Q969U7 264 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 VSIG2Q96IQ7 327 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 VPS39Q96JC1 886 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC30A2Q9BRI3 323 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM121Q9BTD3 319 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF416Q9BWM5 594 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYTH4Q9UIA0 394 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRLS1Q9UJA2 301 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHL21Q9UJP4 597 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 B9D1Q9UPM9 204 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHMP2BQ9UQN3 213 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 GMPPBQ9Y5P6 360 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 PARD3Q8TEW0 1356 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 CROCCQ5TZA2 2017 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1B0GUL7 405 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM74A7A6NL05 159 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLLNB2CW77 178 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 DUX1O43812 170 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 JAK2O60674 1132 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR4F21O95013 312 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 DIRAS3O95661 229 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 IFNB1P01574 187 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSF2P04141 144 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC166P0CW27 439 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZP3P21754 424 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 UGT1A3P35503 534 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPL32P62910 135 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 NTHL1P78549 312 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 RGS1Q08116 209 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNJ11Q14654 390 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIAA0040Q15053 153 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHI3L2Q15782 390 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAPK6Q16659 721 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC01620Q4KN68 170 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM74A3Q4VXF1 159 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 SBK1Q52WX2 424 aa1.98□□□□□ -2.09
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms