RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 OR2I1PQ8NGU4 316 aa16.72■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 MAGIXQ9H6Y5 334 aa16.72■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 WNT16Q9UBV4 365 aa16.72■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 ENTPD4Q9Y227 616 aa16.72■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 FFAR1O14842 300 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 FGF17O60258 216 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 OR2B3O76000 313 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 CHRM4P08173 479 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 PPP2R1BP30154 601 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 SOX18P35713 384 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 FRKP42685 505 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 LAIR1Q6GTX8 287 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 REEP3Q6NUK4 255 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 ARSKQ6UWY0 536 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 DEF8Q6ZN54 512 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 SLC16A11Q8NCK7 471 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 SLC9A6Q92581 669 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 TM4SF19Q96DZ7 209 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 SLC35G5Q96KT7 338 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 C10orf90Q96M02 699 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF681Q96N22 645 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 SLC38A3Q99624 504 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 REEP1Q9H902 201 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 USE1Q9NZ43 259 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 ADAM29Q9UKF5 820 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF691Q5VV52 312 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 ARMC6Q6NXE6 501 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 UBASH3BQ8TF42 649 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 GAL3ST3Q96A11 431 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 TBC1D20Q96BZ9 403 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 FEVQ99581 238 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 CDADC1Q9BWV3 514 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 SCN3BQ9NY72 215 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 DAPP1Q9UN19 280 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 MAPRE3Q9UPY8 281 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 CORO2BQ9UQ03 480 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 EML5Q05BV3 1969 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 A0A0G2JNG1 304 aa16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 A0A0J9YY10 115 aa16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 KIR2DS3K7RE56 304 aa16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 TOR1AO14656 332 aa16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 NME1P15531 152 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 TGFBR2P37173 567 aa16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 RPS5P46782 204 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 CXCL12P48061 93 aa16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 OR1D5P58170 312 aa16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 KIR2DS5Q14953 304 aa16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 OOSP2Q86WS3 158 aa16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 SLC5A8Q8N695 610 aa16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 OR4M2Q8NGB6 313 aa16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF566Q969W8 418 aa16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC32Q9BV29 185 aa16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM38AQ9H6F2 299 aa16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 NEUROD4Q9HD90 331 aa16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 AMBNQ9NP70 447 aa16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 KIF17Q9P2E2 1029 aa16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 NTNG1Q9Y2I2 539 aa16.71■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 TECTAO75443 2155 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 K7ESF4 209 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 DRD2P14416 443 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 FNTBP49356 437 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 GARNL3Q5VVW2 1013 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM65Q6PI78 240 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 C1orf216Q8TAB5 229 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 SETD6Q8TBK2 473 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 SARGQ9BW04 601 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 ACOT13Q9NPJ3 140 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 NPIPA7E9PJI5 369 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 HRKO00198 91 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 TNFSF14O43557 240 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 NDUFA2O43678 99 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 NPIPA8P0DM63 369 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF250P15622 560 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 BLKP51451 505 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 MFSD13AQ14CX5 517 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 TEAD4Q15561 434 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 IGSF11Q5DX21 431 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM151BQ8IW70 566 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 NUP43Q8NFH3 380 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 ELP4Q96EB1 424 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 MMP28Q9H239 520 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 ADAP2Q9NPF8 381 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 FBXO34Q9NWN3 711 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-204ENST00000358923 IL20Q9NYY1 176 aa16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms