RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356657.10

FDPS-201, Transcript of farnesyl diphosphate synthase, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene FDPS, Length 1,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPS-201ENST00000356657 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 ARAFP10398 606 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 DCTP40126 519 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 ATP12AP54707 1039 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 MTPNP58546 118 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 FUT5Q11128 374 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 ZNF141Q15928 474 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 CYP51A1Q16850 503 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 HYAL4Q2M3T9 481 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 SPATS1Q496A3 300 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 GPAT3Q53EU6 434 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 ERICH5Q6P6B1 374 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 FAM180AQ6UWF9 173 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 ZNF605Q86T29 641 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 SULF2Q8IWU5 870 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 GRHL3Q8TE85 626 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 SLC38A5Q8WUX1 472 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 NSL1Q96IY1 281 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 MFRPQ9BY79 579 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 IKZF5Q9H5V7 419 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 L3MBTL1Q9Y468 752 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 WIF1Q9Y5W5 379 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 DSPPQ9NZW4 1301 aa14.65□□□□□ -0.06
FDPS-201ENST00000356657 NPIPB9F8W1W9 429 aa14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 SLC28A2O43868 658 aa14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 H6PDO95479 791 aa14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 CASP9P55211 416 aa14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 C17orf67Q0P5P2 114 aa14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 CCNJQ5T5M9 372 aa14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 REEP3Q6NUK4 255 aa14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 C16orf89Q6UX73 402 aa14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 SLC22A16Q86VW1 577 aa14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 Q8NA96 180 aa14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 BBS10Q8TAM1 723 aa14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 NODALQ96S42 347 aa14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 ZFP64Q9NPA5 681 aa14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 ARL8BQ9NVJ2 186 aa14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 ABCD2Q9UBJ2 740 aa14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 ANGPT4Q9Y264 503 aa14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 CFAP46Q8IYW2 2715 aa14.64□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 B8ZZF3 427 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 BCHEP06276 602 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 ETS2P15036 469 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 ADH7P40394 386 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 MASP1P48740 699 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 MEOX1P50221 254 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 CDK6Q00534 326 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 GRAMD1BQ3KR37 738 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 PRAMEF20Q5VT98 475 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 KRT73Q86Y46 540 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 CMIPQ8IY22 773 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 PEX5LQ8IYB4 626 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 PGAM4Q8N0Y7 254 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 HIPK4Q8NE63 616 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 OR4C3Q8NH37 302 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 TMEM19Q96HH6 336 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 HES7Q9BYE0 225 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 SLC38A1Q9H2H9 487 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 DEPPQ9NTK1 212 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 DTNAQ9Y4J8 743 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 SNPHO15079 494 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 NDUFB5O43674 189 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 FCMRO60667 390 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 PDE9AO76083 593 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 C1QCP02747 245 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 DBIP07108 87 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 ZNF24P17028 368 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 MSX1P28360 303 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 GAS1P54826 345 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 VEZF1Q14119 521 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 SYPL1Q16563 259 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 KLHL26Q53HC5 615 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 RABL3Q5HYI8 236 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 CALHM3Q86XJ0 350 aa14.63□□□□□ -0.07
FDPS-201ENST00000356657 ARHGAP24Q8N264 748 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms