RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326427.10

ITM2C-202, Transcript of integral membrane protein 2C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITM2C, Length 2,078 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2C-202ENST00000326427 YES1P07947 543 aa20.52■□□□□ 0.88
ITM2C-202ENST00000326427 FAM157BP0CG42 384 aa20.52■□□□□ 0.88
ITM2C-202ENST00000326427 WASP42768 502 aa20.52■□□□□ 0.88
ITM2C-202ENST00000326427 P2RY14Q15391 338 aa20.52■□□□□ 0.88
ITM2C-202ENST00000326427 VN1R4Q7Z5H5 301 aa20.52■□□□□ 0.88
ITM2C-202ENST00000326427 PAQR7Q86WK9 346 aa20.52■□□□□ 0.88
ITM2C-202ENST00000326427 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
ITM2C-202ENST00000326427 CDS1Q92903 461 aa20.52■□□□□ 0.88
ITM2C-202ENST00000326427 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
ITM2C-202ENST00000326427 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.52■□□□□ 0.88
ITM2C-202ENST00000326427 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa20.52■□□□□ 0.88
ITM2C-202ENST00000326427 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.52■□□□□ 0.88
ITM2C-202ENST00000326427 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa20.52■□□□□ 0.88
ITM2C-202ENST00000326427 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ITM2C-202ENST00000326427 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 CENPBD1B2RD01 187 aa20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 NCR1O76036 304 aa20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 RUNX3Q13761 415 aa20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 TJAP1Q5JTD0 557 aa20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 C6orf183Q5T699 404 aa20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 PLET1Q6UQ28 207 aa20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 VITQ6UXI7 678 aa20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 ZNF836Q6ZNA1 936 aa20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 TMEM91Q6ZNR0 172 aa20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 SIRT6Q8N6T7 355 aa20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 SAMD8Q96LT4 415 aa20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 KCNJ15Q99712 375 aa20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 TMEM43Q9BTV4 400 aa20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 SLC7A7Q9UM01 511 aa20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 NOX1Q9Y5S8 564 aa20.52■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 SOCS6O14544 535 aa20.51■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 GCGRP47871 477 aa20.51■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 ZNF136P52737 540 aa20.51■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 RPS21P63220 83 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 TNFRSF17Q02223 184 aa20.51■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 MADCAM1Q13477 382 aa20.51■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 TMEM240Q5SV17 173 aa20.51■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa20.51■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 MZT2BQ6NZ67 158 aa20.51■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 MTSS1LQ765P7 747 aa20.51■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 CPOQ8IVL8 374 aa20.51■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 GID4Q8IVV7 300 aa20.51■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 UBE2J2Q8N2K1 259 aa20.51■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 KCT2Q8NC54 265 aa20.51■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 UBQLN3Q9H347 655 aa20.51■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 WDR45Q9Y484 360 aa20.51■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa20.51■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 IGFALSP35858 605 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 SGCGQ13326 291 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 IL18Q14116 193 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 INSL4Q14641 139 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 KLBQ86Z14 1044 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 TCTE3Q8IZS6 198 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 OR2L13Q8N349 312 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 NT5CQ8TCD5 201 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 TMEM246Q9BRR3 403 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 ADAM30Q9UKF2 790 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 CD8B2A6NJW9 211 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 A6NL46 340 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 ISM1B1AKI9 464 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 SGK494L7N484 410 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 SLC19A2O60779 497 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 ZGLP1P0C6A0 271 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 PRKAR1AP10644 381 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 CD8BP10966 210 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 ATP6V1E1P36543 226 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 RACK1P63244 317 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 DUSP8Q13202 625 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 EIPR1Q53HC9 387 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 UBASH3BQ8TF42 649 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 PRSS27Q9BQR3 290 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 YIPF2Q9BWQ6 316 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 FN3KQ9H479 309 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 SLA2Q9H6Q3 261 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 OR6C2Q9NZP2 312 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 MALT1Q9UDY8 824 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 IL20RAQ9UHF4 553 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 MOSPD1Q9UJG1 213 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 SCN3AQ9NY46 2000 aa20.5■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 RFXAPO00287 272 aa20.49■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 LYRM1O43325 122 aa20.49■□□□□ 0.87
ITM2C-202ENST00000326427 THBS1P07996 1170 aa20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms