RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 GPR68Q15743 365 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 CD226Q15762 336 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 NDUFAF6Q330K2 333 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 MMEL1Q495T6 779 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 NANOGP8Q6NSW7 305 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 FAM180AQ6UWF9 173 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 FRRS1Q6ZNA5 592 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 C16orf62Q7Z3J2 963 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 SIAH3Q8IW03 269 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM251Q8N6I4 163 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ANKS4BQ8N8V4 417 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 FBXO27Q8NI29 283 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 SLC38A5Q8WUX1 472 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 FAR1Q8WVX9 515 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 LRRC58Q96CX6 371 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 LRRC37BQ96QE4 947 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF350Q9GZX5 532 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 SLC38A1Q9H2H9 487 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 NANOGQ9H9S0 305 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ARL8BQ9NVJ2 186 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 FBXL2Q9UKC9 423 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 USP22Q9UPT9 525 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 CLDN24A6NM45 220 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 NPIPA5E9PKD4 350 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 NDUFAB1O14561 156 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 OIP5O43482 229 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 PDE9AO76083 593 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 BCHEP06276 602 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 TFPTP0C1Z6 253 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF24P17028 368 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 GPX2P18283 190 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 DCTP40126 519 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 TDGF1P3P51864 188 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 DSTNP60981 165 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 PPIAP62937 165 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 FOXK1P85037 733 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 PLGLB1Q02325 96 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 MAPRE2Q15555 327 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ADRM1Q16186 407 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 FLYWCH1Q4VC44 716 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 GPAT3Q53EU6 434 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 CMPK2Q5EBM0 449 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM81Q6P7N7 255 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC197Q8NCU1 140 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 DUSP19Q8WTR2 217 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 NR4A3Q92570 626 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 SLX1AQ9BQ83 275 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 DEFB127Q9H1M4 99 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 UBQLN4Q9NRR5 601 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 OLAHQ9NV23 265 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 MRGBPQ9NV56 204 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 EXD2Q9NVH0 621 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 NPIPA1Q9UND3 350 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 WDR45Q9Y484 360 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 WIF1Q9Y5W5 379 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 LIPGQ9Y5X9 500 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 GMEB1Q9Y692 573 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 TENM4Q6N022 2769 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 MYO18BQ8IUG5 2567 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ALG1L2C9J202 215 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 STX11O75558 287 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 UGT2B17O75795 530 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 DCTN3O75935 186 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ANGPTL1O95841 491 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 NR2F1P10589 423 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 BMP2P12643 396 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ATP6V1C1P21283 382 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 TBXA2RP21731 343 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 MASP1P48740 699 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 PSPHP78330 225 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 PLAURQ03405 335 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 INAQ16352 499 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 KLHL26Q53HC5 615 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 PDZK1Q5T2W1 519 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ATAD3BQ5T9A4 648 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 TIGD3Q6B0B8 471 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 SLC30A6Q6NXT4 461 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 PACS2Q86VP3 889 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF614Q8N883 585 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF524Q96C55 264 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM19Q96HH6 336 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF597Q96LX8 424 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 G6PC3Q9BUM1 346 aa8.29□□□□□ -1.08
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