RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295925.5

CCNL1-201, Transcript of cyclin L1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNL1, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1-201ENST00000295925 KLF10Q13118 480 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 SLC10A1Q14973 349 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 FLYWCH1Q4VC44 716 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 ZNF614Q8N883 585 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 NTNG2Q96CW9 530 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 PHF12Q96QT6 1004 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 SDF2Q99470 211 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 ARMCX1Q9P291 453 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 FBXL2Q9UKC9 423 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 POLEQ07864 2286 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 MED12Q93074 2177 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 B4DXG7 233 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 SCDO00767 359 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 ANGPTL1O95841 491 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 AGR2O95994 175 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 AK1P00568 194 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 ETFAP13804 333 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 TBXA2RP21731 343 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 DCTP40126 519 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 CRATP43155 626 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 KCNC4Q03721 635 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 RBPJQ06330 500 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 GPR68Q15743 365 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 GPAT3Q53EU6 434 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 FGD2Q7Z6J4 655 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 HMGN2P46Q86SG4 172 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 RETREG3Q86VR2 466 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 PLCZ1Q86YW0 608 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 MSRB3Q8IXL7 192 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 ANKFN1Q8N957 763 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 OR4K17Q8NGC6 315 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 DUSP19Q8WTR2 217 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 ROPN1LQ96C74 230 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 UBQLN3Q9H347 655 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 DSN1Q9H410 356 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 UBQLN4Q9NRR5 601 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 MED11Q9P086 117 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 VAPAQ9P0L0 249 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 MKLN1Q9UL63 735 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 CAPN7Q9Y6W3 813 aa14.93□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 ALG1L2C9J202 215 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 CLIC1O00299 241 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 NDUFB5O43674 189 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 FCMRO60667 390 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 SLC19A2O60779 497 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 SOX30O94993 753 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 MVDP53602 400 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 HPCAP84074 193 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 CD226Q15762 336 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 SYPL1Q16563 259 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 EIPR1Q53HC9 387 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 LRIF1Q5T3J3 769 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 C1QL3Q5VWW1 255 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 TRILQ7L0X0 811 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 DHDDSQ86SQ9 333 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 SNX32Q86XE0 403 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 TRIM8Q9BZR9 551 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 DKKL1Q9UK85 242 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 SLC6A5Q9Y345 797 aa14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 NPIPA2E9PIF3 369 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 NPIPA3F8WFD2 350 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 TNFRSF21O75509 655 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 STX11O75558 287 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 H6PDO95479 791 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 IGHG3P01860 377 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 TPOP07202 933 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 NGFRP08138 427 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 NR2F1P10589 423 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 LCN1P31025 176 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 PTGS2P35354 604 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 DSTNP60981 165 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 NFYCQ13952 458 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 NDUFAF6Q330K2 333 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 PDZK1Q5T2W1 519 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa14.91□□□□□ -0.02
CCNL1-201ENST00000295925 ZNF527Q8NB42 609 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms